More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2633 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 414 aa  801    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  28.82 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  28.82 
 
 		 375 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  28.82 
 
 		 375 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  28.82 
 
 		 375 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  28.82 
 
 		 375 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  29.1 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  28.86 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  29.35 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.52 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  27.76 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  27.76 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.52 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  27.52 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  27.76 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  27.52 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  27.52 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  27.52 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  27.52 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 		 390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.52 
 
 		 387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  28.82 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  28.82 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  28.82 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  30.4 
 
 		 375 aa  153  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 414 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 		 715 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 		 715 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  29.09 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  28.88 
 
 		 715 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  26.04 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 756 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 386 aa  142  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.6 
 
 		 748 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 		 436 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  26.56 
 
 		 767 aa  136  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  29.8 
 
 		 389 aa  136  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 		 767 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.4 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 		 747 aa  132  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 723 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 749 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  29.23 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  28.57 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  30.22 
 
 		 764 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 		 460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.67 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 703 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.47 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 385 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 		 775 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.46 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  28.33 
 
 		 689 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  28.68 
 
 		 423 aa  120  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  27.44 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  26.34 
 
 		 683 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.27 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 419 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  25.92 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  27.99 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 404 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 		 398 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  25.84 
 
 		 951 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.79 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  27.34 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  25.6 
 
 		 435 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  24.09 
 
 		 816 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  26.72 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  25.37 
 
 		 883 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  24.41 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>