More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2522 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  66.67 
 
 
108 aa  159  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.81 
 
 
108 aa  154  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  62.73 
 
 
125 aa  143  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.89 
 
 
108 aa  143  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.72 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.88 
 
 
109 aa  124  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.07 
 
 
110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.53 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.94 
 
 
127 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.38 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.46 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.46 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.62 
 
 
118 aa  105  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
116 aa  105  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
127 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
127 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  48.6 
 
 
141 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  49.53 
 
 
113 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
128 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  52.29 
 
 
106 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2902  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.79 
 
 
117 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302151  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
127 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.53 
 
 
120 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  52.29 
 
 
106 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
124 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.57 
 
 
122 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  45.87 
 
 
118 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
118 aa  103  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  52.29 
 
 
113 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.22 
 
 
116 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  48.6 
 
 
130 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  51.38 
 
 
106 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50.93 
 
 
107 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50.93 
 
 
107 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50 
 
 
107 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
114 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50.93 
 
 
107 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.79 
 
 
118 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.93 
 
 
108 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  51.85 
 
 
107 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
115 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
115 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
105 aa  100  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  49.07 
 
 
107 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.6 
 
 
116 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.07 
 
 
107 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  48.62 
 
 
106 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  51.85 
 
 
107 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  51.85 
 
 
107 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  45.79 
 
 
114 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
114 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  45.79 
 
 
114 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
114 aa  100  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
110 aa  100  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
114 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50 
 
 
107 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.62 
 
 
106 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  50 
 
 
107 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0225  HesB family protein  44.86 
 
 
115 aa  100  9e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
147 aa  100  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.07 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0047  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.6 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
120 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  44.86 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.08 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  44.86 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0036  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
126 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  49.07 
 
 
107 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  50 
 
 
107 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  50 
 
 
107 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.08 
 
 
123 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.07 
 
 
107 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
116 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0044  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
126 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.709192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.07 
 
 
122 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  50 
 
 
107 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  50 
 
 
107 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>