196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2515 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  100 
 
 		 463 aa  937    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  39.3 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  38.6 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  37.31 
 
 		 449 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  34.97 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  29.83 
 
 		 448 aa  176  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  28.45 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  30.34 
 
 		 454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  28.45 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  26.46 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  27.95 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  26.5 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.96 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  25.94 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 		 447 aa  133  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 462 aa  130  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  24.18 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  21.52 
 
 		 430 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.8 
 
 		 463 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 451 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  20.05 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.92 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.12 
 
 		 1470 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  23.99 
 
 		 576 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 427 aa  66.6  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  20.51 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  21.84 
 
 		 731 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  21.9 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.52 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0370  putative outer membrane protein TolC  18.28 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00192444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1738  putative outer membrane protein TolC  18.18 
 
 		 521 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1327  putative outer membrane protein TolC  18.28 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.345184  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0997  putative outer membrane protein TolC  18.18 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471122  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.19 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0296  outer membrane protein TolC, putative  18.18 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  19.66 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  19.66 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0269  putative outer membrane protein TolC  18.18 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0165015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1822  putative outer membrane protein TolC  18.2 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1135  outer membrane protein TolC, putative  18.68 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196284  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.34 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  20.26 
 
 		 972 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  19.17 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  19.96 
 
 		 460 aa  57  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.11 
 
 		 504 aa  57  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  28.23 
 
 		 525 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  19.6 
 
 		 1496 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.71 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  19.75 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  19.41 
 
 		 443 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.8 
 
 		 461 aa  54.3  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  22.07 
 
 		 433 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  28.1 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 627 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.68 
 
 		 479 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.41 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  18.69 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 565 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 437 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  19.5 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.55 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  19.6 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.96 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.41 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0433676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  21.7 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.47 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  20.29 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4182  outer membrane efflux protein  18.28 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4184  outer membrane efflux protein  18.28 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.37 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  27.05 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  19.57 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.18 
 
 		 477 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  20.43 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 528 aa  51.2  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>