More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2420 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  163  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  65.22 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 69 aa  95.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  62.32 
 
 		 70 aa  95.9  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 70 aa  93.6  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  50.72 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  56.72 
 
 		 76 aa  90.1  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  53.62 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  55.07 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  55.07 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  49.28 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  56.52 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  50.68 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  55.07 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 		 76 aa  87  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  55.07 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  55.07 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  62.12 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  49.25 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  50.79 
 
 		 73 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  50.72 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 		 69 aa  83.6  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  53.85 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  46.27 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  46.38 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  48.53 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  53.73 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  54.1 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  54.1 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  46.38 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  49.28 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  44.93 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  47.83 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  53.73 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  47.83 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  49.28 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  49.28 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  44.93 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  49.28 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  45.21 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  49.28 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  49.28 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  49.28 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  49.28 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4526  hypothetical protein  52.31 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0565239 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  55.07 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  49.28 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  43.48 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  47.83 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  43.48 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  47.06 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  52.17 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  47.06 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  51.47 
 
 		 72 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  63.79 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  49.28 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  63.79 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  47.76 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  42.03 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  44.93 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  50.77 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.38 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  52.54 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  46.38 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1255  protein of unknown function DUF37  56 
 
 		 82 aa  76.6  0.00000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000204155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  46.58 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  49.28 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  47.83 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  50.72 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  43.48 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  46.58 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  43.48 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  52.46 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  55.74 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  43.48 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  49.28 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  45.71 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0310  hypothetical protein  53.62 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  49.23 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>