129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2399 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  100 
 
 		 1406 aa  2848    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  40.41 
 
 		 885 aa  429  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  50.9 
 
 		 1152 aa  347  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  49.08 
 
 		 692 aa  248  8e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  39.51 
 
 		 778 aa  198  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  43.46 
 
 		 1362 aa  175  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  33.69 
 
 		 1285 aa  157  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  31.55 
 
 		 1219 aa  153  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  45.71 
 
 		 1059 aa  140  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  51.11 
 
 		 948 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  33.78 
 
 		 1127 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  32.88 
 
 		 1127 aa  128  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  33.9 
 
 		 1127 aa  125  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 		 1127 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  34.91 
 
 		 1146 aa  122  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  35.38 
 
 		 1047 aa  119  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  31.77 
 
 		 1096 aa  118  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  34.68 
 
 		 1123 aa  118  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  30.03 
 
 		 846 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  30.29 
 
 		 846 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  36.86 
 
 		 482 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0709  hypothetical protein  27.81 
 
 		 733 aa  111  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247349  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  28.97 
 
 		 846 aa  108  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  27.82 
 
 		 1004 aa  108  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 		 1129 aa  107  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  32.19 
 
 		 1051 aa  103  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  27.82 
 
 		 848 aa  102  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  34.01 
 
 		 675 aa  102  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 		 1224 aa  102  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  60.24 
 
 		 1414 aa  93.6  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  33.33 
 
 		 1053 aa  92  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  36.99 
 
 		 1132 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  33.51 
 
 		 827 aa  90.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  30.66 
 
 		 499 aa  89.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  34.65 
 
 		 1141 aa  89  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  32.81 
 
 		 1054 aa  89  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  43.75 
 
 		 1275 aa  87  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50 
 
 		 979 aa  86.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.76 
 
 		 915 aa  85.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  42.62 
 
 		 703 aa  84.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2456  secreted metalloprotease  26.23 
 
 		 543 aa  84  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.055863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  27.6 
 
 		 1029 aa  84.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 1143 aa  84  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  42.31 
 
 		 587 aa  84  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  35.51 
 
 		 1601 aa  84  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  41.32 
 
 		 1585 aa  83.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  52.13 
 
 		 1002 aa  81.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  50.52 
 
 		 1217 aa  81.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  37.71 
 
 		 1474 aa  80.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  36.08 
 
 		 991 aa  79.7  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  51.06 
 
 		 1247 aa  79.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  27.94 
 
 		 962 aa  79.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  46.67 
 
 		 1295 aa  77.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.12 
 
 		 984 aa  77.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 1332 aa  74.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  31.1 
 
 		 1771 aa  74.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  27 
 
 		 770 aa  74.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1452 aa  72  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  34.43 
 
 		 343 aa  70.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  36.23 
 
 		 974 aa  70.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  27.98 
 
 		 566 aa  68.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  28.69 
 
 		 480 aa  67.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  45.57 
 
 		 966 aa  66.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 963 aa  65.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  28.87 
 
 		 2552 aa  65.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  33.57 
 
 		 870 aa  64.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2117 aa  63.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  25.6 
 
 		 14944 aa  62.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.81 
 
 		 626 aa  62  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  26.3 
 
 		 1107 aa  62  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  35.6 
 
 		 606 aa  61.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2462  hypothetical protein  38.71 
 
 		 906 aa  61.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  37.31 
 
 		 767 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  22.6 
 
 		 1028 aa  60.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  26.33 
 
 		 12684 aa  60.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.96 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  22.85 
 
 		 1096 aa  58.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.09 
 
 		 626 aa  58.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  29.1 
 
 		 1748 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  22.8 
 
 		 2656 aa  58.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  27.31 
 
 		 820 aa  57  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  25.06 
 
 		 735 aa  57.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  23.98 
 
 		 744 aa  56.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.27 
 
 		 587 aa  56.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  23.69 
 
 		 566 aa  56.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.58 
 
 		 612 aa  55.5  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  26.78 
 
 		 1565 aa  54.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  38.18 
 
 		 1160 aa  54.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  39.13 
 
 		 1223 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  27.18 
 
 		 805 aa  53.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  29.75 
 
 		 14609 aa  53.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  35 
 
 		 1837 aa  53.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  29.08 
 
 		 701 aa  53.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1204 aa  53.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  37.5 
 
 		 663 aa  53.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  32.43 
 
 		 679 aa  52.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  23.21 
 
 		 580 aa  52.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  23.24 
 
 		 513 aa  52  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2228  putative PAS/PAC sensor protein  26.17 
 
 		 652 aa  52  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0829706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  52.08 
 
 		 1302 aa  51.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>