24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2356 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1206    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  49.37 
 
 
572 aa  588  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  47.49 
 
 
582 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  42.58 
 
 
580 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  28.57 
 
 
536 aa  190  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  27.25 
 
 
534 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  27.25 
 
 
534 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  27.25 
 
 
534 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  27.04 
 
 
534 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  27.04 
 
 
534 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  27.04 
 
 
534 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  25 
 
 
534 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  25 
 
 
534 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  20.47 
 
 
500 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  20.47 
 
 
500 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  28.22 
 
 
624 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  22.14 
 
 
494 aa  57  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  24.06 
 
 
483 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  23.26 
 
 
742 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  28.89 
 
 
593 aa  48.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  24.43 
 
 
442 aa  48.5  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  23.83 
 
 
615 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  25.4 
 
 
445 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  24.67 
 
 
506 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>