More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2141 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  100 
 
 		 510 aa  1058    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  43.82 
 
 		 517 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.4 
 
 		 537 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  42.41 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  39.96 
 
 		 694 aa  347  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  39.75 
 
 		 670 aa  341  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  37.03 
 
 		 704 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  36.49 
 
 		 673 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  35.96 
 
 		 669 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 630 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  35.5 
 
 		 640 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  33.13 
 
 		 641 aa  229  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  30.91 
 
 		 631 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  32.72 
 
 		 658 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  31.47 
 
 		 631 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  31.22 
 
 		 620 aa  206  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.04 
 
 		 638 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.86 
 
 		 656 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.51 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.92 
 
 		 673 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  32.39 
 
 		 671 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  28.88 
 
 		 679 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  40.65 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  35.12 
 
 		 645 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.84 
 
 		 668 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  27.76 
 
 		 648 aa  146  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  29.07 
 
 		 665 aa  146  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  29.05 
 
 		 626 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  44.24 
 
 		 1313 aa  143  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  28.81 
 
 		 648 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  29.98 
 
 		 660 aa  136  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  24.6 
 
 		 672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  28.3 
 
 		 677 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  51.22 
 
 		 424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  28.76 
 
 		 594 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 		 653 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  26.43 
 
 		 643 aa  126  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  26.45 
 
 		 903 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  39.2 
 
 		 505 aa  123  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  30.24 
 
 		 519 aa  123  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  26.73 
 
 		 656 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  28.12 
 
 		 650 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  26.92 
 
 		 585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  46.96 
 
 		 241 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  26.48 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  29.04 
 
 		 613 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  48.11 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  30.83 
 
 		 630 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  30.79 
 
 		 642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 		 306 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  43.8 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  24.38 
 
 		 666 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  27.27 
 
 		 712 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  47.75 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  46.36 
 
 		 193 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 		 374 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  34.88 
 
 		 239 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  47.22 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.04 
 
 		 542 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  30.66 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  48.08 
 
 		 543 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 		 459 aa  103  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 623 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  48.08 
 
 		 544 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  41.73 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0605  OmpA/MotB domain protein  34.25 
 
 		 248 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.67 
 
 		 296 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  45.13 
 
 		 209 aa  99.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  40.32 
 
 		 734 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 		 231 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  41.35 
 
 		 464 aa  97.8  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  47.92 
 
 		 399 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  27.89 
 
 		 710 aa  96.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  46.15 
 
 		 233 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  42.45 
 
 		 222 aa  95.5  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.95 
 
 		 422 aa  95.1  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 463 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 		 386 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  39.81 
 
 		 311 aa  93.6  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  31.65 
 
 		 729 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 456 aa  93.2  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  43.81 
 
 		 707 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 		 386 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 		 637 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  48.04 
 
 		 227 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 319 aa  92  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 		 218 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  46.08 
 
 		 319 aa  91.3  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37.61 
 
 		 321 aa  91.3  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  43.64 
 
 		 466 aa  90.9  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>