More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2136 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  100 
 
 
326 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  60.53 
 
 
337 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  58.84 
 
 
340 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.12 
 
 
326 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.35 
 
 
325 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.11 
 
 
329 aa  364  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  50.33 
 
 
315 aa  332  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  46.89 
 
 
319 aa  315  5e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  45.51 
 
 
329 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  45.51 
 
 
329 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  45.51 
 
 
329 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.34 
 
 
319 aa  315  7e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  46.6 
 
 
320 aa  315  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  49.02 
 
 
315 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  48.85 
 
 
312 aa  315  8e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  49.02 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.71 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  45.31 
 
 
353 aa  311  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
329 aa  311  9e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  48.11 
 
 
330 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  48.39 
 
 
347 aa  309  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.38 
 
 
318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  47.98 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.64 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  43.35 
 
 
335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  43.04 
 
 
346 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.96 
 
 
328 aa  305  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  47.04 
 
 
323 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  43.04 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  42.46 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.41 
 
 
354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  43.35 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  46.77 
 
 
320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  44.19 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  45.83 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.6 
 
 
342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 
325 aa  302  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.43 
 
 
310 aa  302  6.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  43.87 
 
 
358 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  45.07 
 
 
336 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
329 aa  300  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.91 
 
 
331 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  46.84 
 
 
324 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  49.36 
 
 
327 aa  300  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.51 
 
 
336 aa  299  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.52 
 
 
325 aa  299  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  46.38 
 
 
325 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.41 
 
 
318 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 
315 aa  298  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  46.45 
 
 
320 aa  298  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.38 
 
 
327 aa  298  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  44.3 
 
 
340 aa  297  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  46.45 
 
 
320 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 
313 aa  297  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  42.09 
 
 
347 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.89 
 
 
313 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.74 
 
 
314 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.28 
 
 
340 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0253  ATPase  46.05 
 
 
329 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.3 
 
 
327 aa  295  5e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.14 
 
 
320 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.66 
 
 
317 aa  295  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.44 
 
 
326 aa  295  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.95 
 
 
333 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  41.99 
 
 
327 aa  294  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.98 
 
 
318 aa  294  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.63 
 
 
341 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.55 
 
 
324 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  41.88 
 
 
332 aa  293  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.84 
 
 
309 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  40.91 
 
 
328 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  44.77 
 
 
346 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  44.04 
 
 
316 aa  291  7e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.45 
 
 
355 aa  291  9e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.98 
 
 
333 aa  290  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  42.81 
 
 
342 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.42 
 
 
353 aa  289  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  41.46 
 
 
350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  45.63 
 
 
325 aa  288  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  42.04 
 
 
340 aa  288  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  47.45 
 
 
318 aa  288  8e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.55 
 
 
342 aa  288  8e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  46.13 
 
 
314 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2421  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.51 
 
 
315 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44 
 
 
322 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  43.22 
 
 
318 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  46.28 
 
 
320 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  43.09 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  43.09 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.95 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  43.09 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  43.35 
 
 
330 aa  286  4e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.51 
 
 
342 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.22 
 
 
349 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.48 
 
 
351 aa  286  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.13 
 
 
316 aa  285  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  43.4 
 
 
332 aa  285  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  46.38 
 
 
318 aa  285  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  44.41 
 
 
317 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  43.09 
 
 
320 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>