179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2119 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  100 
 
 
138 aa  283  7e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 
149 aa  178  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  54.68 
 
 
149 aa  157  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  56.69 
 
 
149 aa  148  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  51.52 
 
 
157 aa  148  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 
137 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  44.93 
 
 
149 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  36.36 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  33.85 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.13 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.87 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  32 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.45 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  30.23 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.85 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1211  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  26.72 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  32.74 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  28.03 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  37.1 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.39 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.6 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  29.17 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.19 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  25.6 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  25.6 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  31.82 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  23.48 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  27.78 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  26.67 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  23.97 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.96 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22071  hypothetical protein  25.93 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>