More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2043 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  56.07 
 
 
1275 aa  828    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  71.92 
 
 
1414 aa  645    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  91.88 
 
 
1002 aa  960    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  78.14 
 
 
1585 aa  1165    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  80.42 
 
 
1217 aa  1046    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  100 
 
 
1247 aa  2476    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  81.53 
 
 
1474 aa  1055    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  47.64 
 
 
1748 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  45.41 
 
 
1160 aa  357  7.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  40.93 
 
 
1223 aa  332  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  51.21 
 
 
1266 aa  327  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  51.16 
 
 
1295 aa  307  8.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  44.39 
 
 
3793 aa  253  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  52.64 
 
 
1108 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  40.53 
 
 
541 aa  238  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  37.92 
 
 
1657 aa  206  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  36.68 
 
 
1186 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  36.96 
 
 
574 aa  202  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  46.58 
 
 
991 aa  194  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  33.23 
 
 
997 aa  186  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  44.98 
 
 
1288 aa  183  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  34.67 
 
 
721 aa  179  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 
325 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  31.19 
 
 
1329 aa  174  9e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  36.15 
 
 
2270 aa  170  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  32.52 
 
 
325 aa  165  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  33.65 
 
 
2713 aa  162  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.45 
 
 
1068 aa  140  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  33.41 
 
 
1547 aa  131  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03863  glycosyl hydrolase family 10  30.58 
 
 
271 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.26 
 
 
989 aa  124  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  35.14 
 
 
1418 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  35.84 
 
 
1152 aa  114  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  34.09 
 
 
815 aa  110  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  28.94 
 
 
423 aa  108  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  28.94 
 
 
674 aa  108  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  31.29 
 
 
806 aa  106  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.33 
 
 
1607 aa  105  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  27.7 
 
 
333 aa  103  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  26.81 
 
 
347 aa  99.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  26.45 
 
 
347 aa  99.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  29.37 
 
 
491 aa  97.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  29.11 
 
 
497 aa  97.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  27.57 
 
 
488 aa  97.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
639 aa  95.5  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  26.3 
 
 
487 aa  95.1  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  26.71 
 
 
490 aa  94.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  28.23 
 
 
820 aa  94.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  28.1 
 
 
474 aa  94  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
678 aa  94  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  27.62 
 
 
912 aa  92.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  28.87 
 
 
778 aa  92.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  26.35 
 
 
543 aa  91.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  29.45 
 
 
357 aa  90.9  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  30.37 
 
 
2402 aa  91.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  31.02 
 
 
215 aa  89.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  25.95 
 
 
371 aa  89.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  35.48 
 
 
1050 aa  89.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  27.72 
 
 
925 aa  89.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  28.77 
 
 
1019 aa  89.4  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 
837 aa  89  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  31.35 
 
 
1020 aa  88.6  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  24.91 
 
 
477 aa  87.4  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  26.49 
 
 
690 aa  87  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.54 
 
 
1507 aa  85.9  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  53.19 
 
 
1601 aa  85.5  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  26.21 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  32.49 
 
 
626 aa  84  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  22.75 
 
 
1331 aa  83.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  45.3 
 
 
1362 aa  83.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.65 
 
 
1059 aa  82.4  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  30.65 
 
 
1059 aa  82.4  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  27.24 
 
 
1495 aa  82  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  31.68 
 
 
2262 aa  82  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  33.17 
 
 
1980 aa  82  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  26.82 
 
 
503 aa  81.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  27.44 
 
 
1313 aa  81.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  30.17 
 
 
1488 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  51.06 
 
 
1406 aa  79.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  27.65 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  25.78 
 
 
822 aa  78.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  31.24 
 
 
4429 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 
606 aa  77.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  27.11 
 
 
323 aa  77  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  27.5 
 
 
357 aa  77.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.27 
 
 
984 aa  76.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 
628 aa  76.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  25.93 
 
 
1287 aa  76.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 
915 aa  76.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  27.55 
 
 
756 aa  75.1  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.33 
 
 
1343 aa  75.1  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  28.57 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  27.96 
 
 
357 aa  74.3  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  25.94 
 
 
815 aa  74.3  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  27.34 
 
 
337 aa  74.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  24.21 
 
 
401 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  23.74 
 
 
373 aa  73.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  29.36 
 
 
483 aa  73.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 
760 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  43.62 
 
 
1059 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>