More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2040 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  100 
 
 
1002 aa  2000    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  92.17 
 
 
1585 aa  927    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  92.17 
 
 
1217 aa  931    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  91.88 
 
 
1247 aa  936    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  93.62 
 
 
1474 aa  942    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  56.18 
 
 
1275 aa  497  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  47.71 
 
 
1748 aa  315  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  43.03 
 
 
1223 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  46.4 
 
 
1160 aa  288  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  49.09 
 
 
1295 aa  280  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  45.91 
 
 
1266 aa  211  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  42.31 
 
 
3793 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  43.56 
 
 
1108 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  36.72 
 
 
1288 aa  131  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  35.82 
 
 
1657 aa  127  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  37.72 
 
 
1418 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  42.25 
 
 
991 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  31.72 
 
 
795 aa  104  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  44.4 
 
 
1414 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  25.87 
 
 
316 aa  99  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  52.83 
 
 
1152 aa  94.7  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  30.21 
 
 
1329 aa  94.4  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.69 
 
 
313 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  29.3 
 
 
280 aa  91.7  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  31.88 
 
 
2270 aa  91.3  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  31.01 
 
 
2713 aa  90.9  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.31 
 
 
322 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.05 
 
 
353 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  31.35 
 
 
1020 aa  90.1  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  35.48 
 
 
1050 aa  89.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  34.91 
 
 
317 aa  88.6  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  30.48 
 
 
215 aa  87  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.89 
 
 
462 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  25.98 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  53.19 
 
 
1362 aa  85.1  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  29.19 
 
 
1059 aa  84  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  29.19 
 
 
1059 aa  84  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  52.69 
 
 
1601 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  32.49 
 
 
626 aa  84  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  27.21 
 
 
325 aa  82.8  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  28.71 
 
 
1495 aa  81.3  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  32.34 
 
 
335 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  34.59 
 
 
659 aa  80.9  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  52.13 
 
 
1406 aa  81.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  22.85 
 
 
357 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  39.2 
 
 
815 aa  78.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.58 
 
 
363 aa  77.4  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.37 
 
 
915 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.16 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.31 
 
 
984 aa  75.1  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  31.62 
 
 
1547 aa  74.7  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.52 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  27.81 
 
 
1018 aa  72.8  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  29.55 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  31.49 
 
 
2286 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.37 
 
 
1343 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  43.18 
 
 
1132 aa  71.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.91 
 
 
464 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  32.16 
 
 
1215 aa  70.1  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  40.95 
 
 
1059 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  30.67 
 
 
398 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  25.8 
 
 
324 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.64 
 
 
1146 aa  69.7  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  40.34 
 
 
1123 aa  69.3  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  23.29 
 
 
341 aa  69.7  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  50 
 
 
778 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.83 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  26.97 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  24.46 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  27.59 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  30.83 
 
 
365 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  30.83 
 
 
369 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  30.83 
 
 
365 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  30.83 
 
 
365 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  25.95 
 
 
925 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  25.19 
 
 
518 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  27.82 
 
 
461 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  33.94 
 
 
703 aa  66.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  35.64 
 
 
1285 aa  66.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  24.48 
 
 
332 aa  65.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  28.61 
 
 
2402 aa  66.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  26.04 
 
 
343 aa  65.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.34 
 
 
374 aa  65.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  22.5 
 
 
471 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  26.1 
 
 
1100 aa  65.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  30.56 
 
 
451 aa  65.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  28.19 
 
 
381 aa  65.1  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  31.54 
 
 
414 aa  63.9  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.01 
 
 
1607 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  39.18 
 
 
1127 aa  64.3  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  25.83 
 
 
447 aa  64.3  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  43.82 
 
 
962 aa  63.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.86 
 
 
979 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  35.61 
 
 
334 aa  63.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  39.18 
 
 
1127 aa  63.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  32.31 
 
 
419 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.79 
 
 
344 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  28.66 
 
 
369 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  39.56 
 
 
587 aa  63.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  26.54 
 
 
304 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>