More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2026 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
261 aa  537  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  61.57 
 
 
264 aa  345  4e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  61.86 
 
 
248 aa  315  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  60.43 
 
 
258 aa  312  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  57.87 
 
 
263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  62.98 
 
 
246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  58.78 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 
255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  59.32 
 
 
259 aa  301  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  56.97 
 
 
262 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  57.74 
 
 
262 aa  297  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  56.36 
 
 
265 aa  296  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
249 aa  295  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  56.96 
 
 
271 aa  291  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 
254 aa  290  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  56.28 
 
 
268 aa  286  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  55.6 
 
 
251 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  56.9 
 
 
256 aa  285  4e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  51.78 
 
 
263 aa  279  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
247 aa  276  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  55.46 
 
 
249 aa  271  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  53.45 
 
 
263 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  52.56 
 
 
236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  53.71 
 
 
249 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  53.91 
 
 
236 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 
249 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 
249 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
249 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  51.81 
 
 
255 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
255 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  48.35 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  47.03 
 
 
258 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  44.27 
 
 
296 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  48.52 
 
 
249 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  48.1 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  44.96 
 
 
266 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  45.96 
 
 
247 aa  221  9e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  45.06 
 
 
273 aa  220  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  44.27 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  44.27 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  47.33 
 
 
278 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  43.19 
 
 
289 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  43.35 
 
 
286 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  45.15 
 
 
265 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  44.77 
 
 
288 aa  214  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  44.9 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  44.9 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  45.38 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  45.49 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  41.86 
 
 
298 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  42.74 
 
 
274 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  44.02 
 
 
248 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  42.31 
 
 
243 aa  208  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  41.77 
 
 
296 aa  208  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  43.16 
 
 
275 aa  208  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  41.25 
 
 
298 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  42.23 
 
 
252 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
296 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  41.88 
 
 
257 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  40.94 
 
 
296 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  42.26 
 
 
251 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  42.74 
 
 
275 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  44.07 
 
 
266 aa  205  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  45.3 
 
 
299 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  39.37 
 
 
296 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  39.37 
 
 
296 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  39.37 
 
 
296 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  41.25 
 
 
252 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  42.31 
 
 
275 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  41.25 
 
 
252 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  42.45 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.67 
 
 
248 aa  199  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  40.7 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3453  ABC transporter related  44.49 
 
 
300 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.859541 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  41.7 
 
 
280 aa  199  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 
238 aa  198  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  39.29 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  39.29 
 
 
273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  39.29 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  39.29 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  41.53 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  39.29 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  42.37 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
248 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 
265 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 
265 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  43.64 
 
 
251 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  40.25 
 
 
237 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  40.98 
 
 
267 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  44.81 
 
 
258 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  41.28 
 
 
249 aa  185  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  38.3 
 
 
265 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  38.87 
 
 
255 aa  183  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  38.63 
 
 
251 aa  183  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 
254 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0292  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  39.65 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>