32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2017 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  413  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.41 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.19 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.75 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  37.86 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.47 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.32 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  34.87 
 
 		 177 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  31.79 
 
 		 177 aa  98.2  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  31.28 
 
 		 177 aa  95.1  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  32.31 
 
 		 177 aa  94.7  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  36.49 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  36.49 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.5 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.89 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.08 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  44.19 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.33 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0632  biopolymer transport protein ExbD, putative  40.58 
 
 		 139 aa  45.1  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.362389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.53 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.93 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  32.31 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1697  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.89 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>