121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2003 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2003  permease  100 
 
 		 435 aa  883    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  54.61 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  50 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  46.81 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 439 aa  355  8.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  46.95 
 
 		 441 aa  353  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  33.8 
 
 		 453 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  32.25 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  32.71 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  30.42 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  32.7 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  29.71 
 
 		 462 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  31.92 
 
 		 408 aa  208  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  32.14 
 
 		 460 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  29.71 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 442 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 469 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 572 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27.79 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  28.71 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 421 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 439 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  28.71 
 
 		 427 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  28.1 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  28.97 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  30.39 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  28.47 
 
 		 427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  29.69 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  28.24 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  28.24 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  28.24 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  28.24 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  28.24 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  26.08 
 
 		 458 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  30.3 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 436 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 404 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 447 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  25.06 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  25 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 414 aa  123  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  25.86 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  22.35 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  26.04 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 435 aa  110  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  23 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 462 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  22.52 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 465 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 466 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  23.34 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 493 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 460 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 468 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  25.53 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  25.5 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  20.93 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07591  Autophagy-related protein 22-2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVT9]  23.13 
 
 		 593 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00360  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>