More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1955 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  100 
 
 		 153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  60.53 
 
 		 153 aa  198  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3480  SsrA-binding protein  58.11 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.010322  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  59.86 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  56.55 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0162  SsrA-binding protein  58.27 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  55.17 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  51.47 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  51.47 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  52.14 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 153 aa  146  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1552  SsrA-binding protein  54.93 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.350256 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  52.27 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0707  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  52.9 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0569  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909805  normal  0.26821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  50.37 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3443  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  43.71 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  44.93 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  44.93 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  46.76 
 
 		 155 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  44 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  42.67 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  49.26 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  50.37 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  42.03 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  45.65 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 161 aa  134  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  44.6 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  40.67 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  41.22 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  45.64 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.89 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  43.15 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0862  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  44.3 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  41.22 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  42.38 
 
 		 155 aa  130  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  44.93 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  44.93 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  45.65 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  45.59 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  39.86 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  40.58 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  43.62 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  40.67 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  42.03 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  48.51 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  45.59 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  45.65 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>