More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1929 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  100 
 
 
173 aa  356  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  60.61 
 
 
171 aa  224  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  62.35 
 
 
174 aa  208  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  57.99 
 
 
171 aa  198  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  60.12 
 
 
172 aa  192  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  54.12 
 
 
169 aa  189  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  51.48 
 
 
170 aa  170  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
169 aa  145  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  41.03 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  41.03 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  40.38 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  43.41 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  38.82 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.91 
 
 
159 aa  114  5e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  40.67 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.74 
 
 
168 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 
161 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  37.75 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.04 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
175 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  44.17 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  40.44 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
168 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  38.75 
 
 
170 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  41.04 
 
 
168 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 
160 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  39.38 
 
 
170 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  41.04 
 
 
165 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 
163 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  42.5 
 
 
163 aa  105  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  38.12 
 
 
170 aa  104  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  38.75 
 
 
170 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.75 
 
 
170 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  38.12 
 
 
170 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.75 
 
 
170 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  38.75 
 
 
170 aa  103  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.75 
 
 
170 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 
167 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  36.84 
 
 
166 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 
167 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.58 
 
 
164 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.12 
 
 
170 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  36.84 
 
 
166 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1965  thioesterase superfamily protein  47.76 
 
 
198 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  36.36 
 
 
176 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  36.36 
 
 
176 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 
161 aa  101  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 
173 aa  101  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  35.57 
 
 
159 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 
161 aa  99  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 
162 aa  98.2  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 
188 aa  97.4  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  34.19 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  35.76 
 
 
187 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  33.79 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  33.99 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  37.96 
 
 
187 aa  95.5  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2687  thioesterase superfamily protein  44.8 
 
 
167 aa  95.5  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.793889  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  36.08 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 
161 aa  94  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  38.52 
 
 
146 aa  94.4  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  36.92 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  36.76 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  35.07 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  42.02 
 
 
132 aa  92.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  37.88 
 
 
139 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 
185 aa  90.9  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0104  thioesterase superfamily protein  39.1 
 
 
318 aa  89.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.82 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
139 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
170 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  34.69 
 
 
185 aa  89  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
161 aa  89  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1140  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 
159 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>