137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1788 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1788  permease  100 
 
 		 483 aa  983    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  41.98 
 
 		 498 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  42.71 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  36.67 
 
 		 527 aa  344  2e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  40.17 
 
 		 480 aa  320  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  38.72 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  31.98 
 
 		 651 aa  260  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  28.73 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  30.35 
 
 		 481 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  28.76 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  27.53 
 
 		 442 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  29.75 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  28.04 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  28.42 
 
 		 495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  28.48 
 
 		 442 aa  179  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.75 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  29.87 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 417 aa  107  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  27.23 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  29.05 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  29.28 
 
 		 389 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  27.12 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.73 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  28.02 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.84 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 792 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.72 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  26.8 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  25.1 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.1 
 
 		 371 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 1040 aa  63.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  27.46 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 356 aa  63.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  21.05 
 
 		 397 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  32.76 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  29.55 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  22.94 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  21.78 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.71 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  26.94 
 
 		 357 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  29.69 
 
 		 364 aa  60.1  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  29.55 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.17 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.71 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.9 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.81 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.08 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 1096 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  23.67 
 
 		 364 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  25.29 
 
 		 377 aa  55.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  22.76 
 
 		 378 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  26 
 
 		 391 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 394 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  31.11 
 
 		 389 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  32.06 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.76 
 
 		 359 aa  53.5  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  24.78 
 
 		 396 aa  53.5  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  21.76 
 
 		 418 aa  53.5  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  30.23 
 
 		 384 aa  53.5  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  25.56 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  27.01 
 
 		 357 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  20.8 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  26 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  26.13 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 1061 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 387 aa  52  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 1061 aa  50.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  28.04 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  21.31 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  21.89 
 
 		 360 aa  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  20.52 
 
 		 393 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  23.13 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  20.17 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  23.13 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 		 364 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  20.52 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  24.06 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  28.89 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  25 
 
 		 401 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  20.17 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  21.03 
 
 		 397 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  21.68 
 
 		 376 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  21.68 
 
 		 376 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>