More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1710 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 		 640 aa  1329    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  48.99 
 
 		 641 aa  597  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  42.14 
 
 		 620 aa  459  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.25 
 
 		 673 aa  412  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  40.12 
 
 		 519 aa  358  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 631 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  37.43 
 
 		 631 aa  317  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.87 
 
 		 658 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  36.29 
 
 		 638 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  31.9 
 
 		 656 aa  297  4e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  37.6 
 
 		 630 aa  293  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  32.05 
 
 		 671 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  31.01 
 
 		 648 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  35.99 
 
 		 669 aa  264  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  32.66 
 
 		 668 aa  262  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  34.01 
 
 		 694 aa  256  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  30.41 
 
 		 648 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 		 704 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  33.33 
 
 		 670 aa  236  7e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.5 
 
 		 510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.36 
 
 		 525 aa  230  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.88 
 
 		 656 aa  229  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  28.98 
 
 		 679 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  29.58 
 
 		 672 aa  228  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30.74 
 
 		 537 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  32.75 
 
 		 517 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  32.56 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  29.73 
 
 		 643 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.85 
 
 		 903 aa  201  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  27.39 
 
 		 673 aa  200  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  26.84 
 
 		 666 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  26.99 
 
 		 650 aa  195  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  26.84 
 
 		 626 aa  188  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  28.16 
 
 		 665 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  27.51 
 
 		 712 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  31.83 
 
 		 660 aa  184  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.31 
 
 		 645 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  28.5 
 
 		 630 aa  178  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.86 
 
 		 653 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  30.25 
 
 		 642 aa  168  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  31.08 
 
 		 677 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  23.76 
 
 		 710 aa  144  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  27.26 
 
 		 585 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  25.59 
 
 		 757 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  27.92 
 
 		 798 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.51 
 
 		 613 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  27.76 
 
 		 586 aa  127  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  34.56 
 
 		 432 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  24.96 
 
 		 594 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  42.5 
 
 		 239 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 		 427 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  36.67 
 
 		 734 aa  113  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  39.39 
 
 		 1313 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  30.07 
 
 		 712 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  46.55 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  47.01 
 
 		 241 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  44.03 
 
 		 422 aa  105  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  39.76 
 
 		 778 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  46.72 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  46.72 
 
 		 375 aa  102  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 813 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  33.89 
 
 		 263 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  33.86 
 
 		 300 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  38.93 
 
 		 333 aa  100  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.71 
 
 		 230 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 362 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  42.97 
 
 		 365 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  43.52 
 
 		 466 aa  99  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.71 
 
 		 240 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  45.37 
 
 		 454 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  44.34 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  33.65 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  40.44 
 
 		 440 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  29.8 
 
 		 316 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  44.34 
 
 		 463 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  44.12 
 
 		 457 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 388 aa  95.5  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 468 aa  95.1  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 459 aa  95.1  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  45.79 
 
 		 456 aa  95.1  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  44.95 
 
 		 429 aa  94.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 223 aa  94.4  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 226 aa  94.4  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  45.13 
 
 		 727 aa  94  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.87 
 
 		 407 aa  94  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  43.52 
 
 		 233 aa  94  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.04 
 
 		 447 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  42.16 
 
 		 320 aa  93.2  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  39.34 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 466 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 296 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 		 193 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 502 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 376 aa  92  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.95 
 
 		 294 aa  92  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 		 361 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  46.79 
 
 		 266 aa  91.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  44.12 
 
 		 321 aa  91.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  44.12 
 
 		 427 aa  91.3  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>