More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1695 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1695  ATPase  100 
 
 
376 aa  767    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.03 
 
 
383 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.9 
 
 
407 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.97 
 
 
387 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.33 
 
 
382 aa  190  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  35.27 
 
 
390 aa  182  6e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.5 
 
 
375 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  41.22 
 
 
523 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  37.37 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  37.79 
 
 
498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  39.72 
 
 
506 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  37.75 
 
 
498 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  40.47 
 
 
498 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  38.05 
 
 
498 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  38.05 
 
 
498 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  38.05 
 
 
498 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  37.41 
 
 
489 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  38.05 
 
 
498 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.05 
 
 
498 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  37.46 
 
 
498 aa  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  38.05 
 
 
506 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  40.13 
 
 
498 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  40.13 
 
 
498 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  40.13 
 
 
498 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  40.13 
 
 
498 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  39.57 
 
 
512 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.79 
 
 
526 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  39.57 
 
 
512 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  36.68 
 
 
509 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  36.36 
 
 
543 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  38.41 
 
 
499 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  38.13 
 
 
499 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  39.57 
 
 
512 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  40.44 
 
 
468 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  39.19 
 
 
498 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  39.43 
 
 
499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  36.68 
 
 
546 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  35.33 
 
 
547 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  35.61 
 
 
553 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  34.67 
 
 
552 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  38.08 
 
 
382 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  34.11 
 
 
553 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  35.79 
 
 
464 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  35.5 
 
 
530 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  39.75 
 
 
466 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  33.55 
 
 
560 aa  153  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.38 
 
 
528 aa  152  8e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.98 
 
 
389 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.08 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  37.12 
 
 
498 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  38.69 
 
 
379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  34.14 
 
 
368 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  35.98 
 
 
368 aa  123  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  31.79 
 
 
368 aa  122  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  36.79 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.13 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  29.04 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  27.48 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  28.31 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  28.31 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  27.36 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  28.83 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  26.78 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  28.31 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  26.96 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  28 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  25 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.99 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  25.68 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  25 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.13 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  28.72 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  26.19 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.12 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  27.42 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  27.42 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  27.87 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0818  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.09 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.761606  normal  0.617267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  26.35 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  26.71 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  26.16 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  23.43 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  27.7 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  28.38 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  21.6 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  28.38 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  28.04 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.98 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  26.43 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  22.84 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  26.28 
 
 
314 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.9 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  27.04 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.21 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1989  Von Willebrand factor type A domain containing membrane protein  25.35 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  28.07 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.01 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  27.95 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  24.19 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  28.87 
 
 
353 aa  67  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>