211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1660 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  58.47 
 
 
639 aa  782    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1285  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  52.78 
 
 
655 aa  693    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  57.75 
 
 
641 aa  784    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  60.8 
 
 
657 aa  826    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  100 
 
 
637 aa  1325    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  51.18 
 
 
655 aa  658    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  60 
 
 
647 aa  813    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  58.88 
 
 
637 aa  800    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  57.48 
 
 
642 aa  798    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  59.49 
 
 
670 aa  816    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  59.33 
 
 
642 aa  808    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  61.44 
 
 
646 aa  828    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  52.77 
 
 
642 aa  630  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  54.13 
 
 
303 aa  271  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.31 
 
 
256 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.08 
 
 
256 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.88 
 
 
264 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.92 
 
 
253 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.39 
 
 
242 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.48 
 
 
263 aa  203  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  46.99 
 
 
242 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.81 
 
 
251 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.76 
 
 
268 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.03 
 
 
262 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.22 
 
 
241 aa  196  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.12 
 
 
259 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.26 
 
 
242 aa  193  9e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.38 
 
 
268 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.2 
 
 
268 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.63 
 
 
249 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.7 
 
 
250 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  44 
 
 
252 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.37 
 
 
253 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.67 
 
 
261 aa  186  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.77 
 
 
279 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.64 
 
 
236 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.12 
 
 
265 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.56 
 
 
242 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.08 
 
 
266 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.19 
 
 
245 aa  180  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.68 
 
 
260 aa  180  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.08 
 
 
266 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.08 
 
 
266 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.08 
 
 
266 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.08 
 
 
266 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.08 
 
 
266 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.04 
 
 
260 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.3 
 
 
266 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.49 
 
 
260 aa  178  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.66 
 
 
266 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00635  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
266 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.92 
 
 
266 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2978  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
266 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0769  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
266 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136799  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00626  hypothetical protein  39.92 
 
 
266 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
266 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0573  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
266 aa  176  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0722  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
266 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.372156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0703  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
266 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00284745  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  40.17 
 
 
260 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.49 
 
 
266 aa  174  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.614639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.39 
 
 
252 aa  173  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.39 
 
 
252 aa  173  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0338  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.49 
 
 
266 aa  173  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368594  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.23 
 
 
244 aa  173  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2997  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.49 
 
 
266 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.26 
 
 
263 aa  172  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.75 
 
 
266 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.36 
 
 
262 aa  171  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.76 
 
 
262 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.76 
 
 
262 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.76 
 
 
262 aa  170  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.76 
 
 
262 aa  170  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.76 
 
 
262 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.76 
 
 
262 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.76 
 
 
262 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.98 
 
 
233 aa  170  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.17 
 
 
262 aa  170  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  38.67 
 
 
339 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.7 
 
 
266 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.17 
 
 
266 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1549  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.28 
 
 
271 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000670802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.72 
 
 
270 aa  169  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.04 
 
 
262 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  38.04 
 
 
358 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.08 
 
 
276 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.24 
 
 
262 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3128  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.31 
 
 
266 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1203  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.62 
 
 
266 aa  165  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.11 
 
 
247 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 
243 aa  164  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1114  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.46 
 
 
266 aa  164  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.646109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4483  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.41 
 
 
261 aa  164  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.543122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.41 
 
 
277 aa  163  9e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.67 
 
 
236 aa  163  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.81 
 
 
266 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.67 
 
 
261 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.81 
 
 
270 aa  161  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.07 
 
 
233 aa  161  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.06 
 
 
266 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>