More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1644a on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  71.88 
 
 		 64 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  68.25 
 
 		 64 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  59.38 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  58.06 
 
 		 65 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  61.29 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  58.06 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  58.62 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00825  ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  54.84 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  53.12 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0083  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000192427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  54.84 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0346  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>