More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1631 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  308  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  73.72 
 
 		 160 aa  239  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  73.72 
 
 		 157 aa  229  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  66.67 
 
 		 157 aa  210  5.999999999999999e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  64.1 
 
 		 157 aa  198  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  62.82 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 157 aa  188  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  56.41 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  54.3 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1240  transcription elongation factor GreA  55.19 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 176 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  44.52 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  43.62 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  42.28 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  48.15 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  42.28 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  45.95 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  43.24 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0255  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000533555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  41.22 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  43.84 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  42.47 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4190  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164972  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  42.41 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  42.41 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  44.76 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  43.24 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  43.24 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  39.87 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  43.24 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  43.24 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0768  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  42.41 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  40.82 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  42.07 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  45.32 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>