75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1558 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  100 
 
 		 519 aa  1070    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  40.12 
 
 		 640 aa  358  9e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  37.26 
 
 		 641 aa  332  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  35.58 
 
 		 620 aa  299  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.1 
 
 		 673 aa  277  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  34.35 
 
 		 648 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.11 
 
 		 658 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  29.29 
 
 		 631 aa  200  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  33.87 
 
 		 669 aa  183  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  35.12 
 
 		 670 aa  183  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.18 
 
 		 656 aa  172  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  26.11 
 
 		 638 aa  170  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  27.73 
 
 		 630 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  29.32 
 
 		 694 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.75 
 
 		 631 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.73 
 
 		 525 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  26.43 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  29.12 
 
 		 704 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  31.45 
 
 		 673 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  28.87 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  26.74 
 
 		 679 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 798 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  25.95 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.24 
 
 		 510 aa  123  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  33.73 
 
 		 594 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  25.94 
 
 		 671 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  24.42 
 
 		 712 aa  120  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 		 645 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  27 
 
 		 648 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  26.42 
 
 		 668 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  40.36 
 
 		 778 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.99 
 
 		 903 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  27.8 
 
 		 712 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  25.54 
 
 		 734 aa  110  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  25.94 
 
 		 672 aa  109  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 813 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  24.49 
 
 		 665 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  26.98 
 
 		 585 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.71 
 
 		 613 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  29.11 
 
 		 630 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  29.8 
 
 		 650 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  26.1 
 
 		 656 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  32.87 
 
 		 757 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.68 
 
 		 660 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  30.21 
 
 		 642 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  29.25 
 
 		 626 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  28.42 
 
 		 666 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  32.46 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  25.89 
 
 		 653 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  26.2 
 
 		 643 aa  86.7  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  30.16 
 
 		 293 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  37.5 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  29.32 
 
 		 263 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  30.88 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  32.45 
 
 		 316 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  38.52 
 
 		 710 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  23.74 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  25.19 
 
 		 677 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1161  hypothetical protein  26.71 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2689  WD40 domain protein beta Propeller  44 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  33.94 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  21.5 
 
 		 789 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  26.73 
 
 		 296 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  25.25 
 
 		 299 aa  57  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1660  hypothetical protein  26.14 
 
 		 288 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0438  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.37 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000271356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  34.41 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  52.27 
 
 		 306 aa  55.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2161  WD40 domain protein beta Propeller  31.65 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.14 
 
 		 367 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0562  WD40 domain-containing protein  32.33 
 
 		 297 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  27.2 
 
 		 379 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 776 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1372  hypothetical protein  37.33 
 
 		 473 aa  48.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.163525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3857  WD40 domain protein beta Propeller  23.75 
 
 		 290 aa  47.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>