More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1542 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  100 
 
 
429 aa  875    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  48.59 
 
 
428 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  47.18 
 
 
428 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  45.69 
 
 
433 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  45.54 
 
 
404 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  46.62 
 
 
428 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  43.85 
 
 
429 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  42.99 
 
 
404 aa  349  7e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  42.29 
 
 
408 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  37.29 
 
 
442 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.77 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.42 
 
 
431 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  32.65 
 
 
441 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  35.28 
 
 
429 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  35.94 
 
 
429 aa  247  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.11 
 
 
441 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  36 
 
 
422 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  33.56 
 
 
422 aa  239  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  34.66 
 
 
424 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  33.49 
 
 
457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.22 
 
 
439 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.43 
 
 
424 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.91 
 
 
427 aa  232  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 
438 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
422 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  33.56 
 
 
431 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  37.19 
 
 
434 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  32.94 
 
 
413 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
813 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  35.34 
 
 
431 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  33.49 
 
 
437 aa  227  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  32.72 
 
 
431 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  33.66 
 
 
459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  30.82 
 
 
443 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
436 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
428 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  36.43 
 
 
443 aa  223  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  34.23 
 
 
451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.65 
 
 
432 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  34.22 
 
 
411 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  36.96 
 
 
437 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  36.96 
 
 
435 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  32.41 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  31.78 
 
 
817 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  32.96 
 
 
453 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  34.79 
 
 
424 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  32.51 
 
 
810 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.49 
 
 
466 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 
418 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  32.6 
 
 
425 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 
418 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  34.09 
 
 
428 aa  209  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  34.38 
 
 
440 aa  209  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  30.34 
 
 
847 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  34.23 
 
 
413 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  32.74 
 
 
447 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  32.75 
 
 
426 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  35.47 
 
 
428 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  32.05 
 
 
424 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  30.94 
 
 
878 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  32.1 
 
 
440 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  31.42 
 
 
433 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  32.84 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  36.48 
 
 
465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.63 
 
 
425 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  36.23 
 
 
407 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  34.13 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  32.06 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  31.7 
 
 
445 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  34.22 
 
 
427 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.14 
 
 
424 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  33.69 
 
 
381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  31.22 
 
 
437 aa  196  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  34.69 
 
 
416 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  34.4 
 
 
414 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  34.05 
 
 
463 aa  195  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  32.93 
 
 
425 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  35.02 
 
 
416 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  29.27 
 
 
840 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  34.09 
 
 
420 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.48 
 
 
422 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 
423 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
452 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  32.65 
 
 
421 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  31.35 
 
 
432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 
438 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  29.49 
 
 
433 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  30.28 
 
 
427 aa  190  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  31.24 
 
 
419 aa  190  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  32.36 
 
 
430 aa  190  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.3 
 
 
433 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  30.05 
 
 
435 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.88 
 
 
421 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  30.09 
 
 
425 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0758  FolC bifunctional protein  31.7 
 
 
451 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000171219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  29.95 
 
 
433 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  30.07 
 
 
430 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  29.95 
 
 
433 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.26 
 
 
433 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>