More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1383 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1383  transport protein  100 
 
 
434 aa  874    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  55.61 
 
 
438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  50.6 
 
 
430 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  40.87 
 
 
428 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  40.48 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  39.81 
 
 
437 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  38.44 
 
 
446 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  38.62 
 
 
442 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  37.05 
 
 
433 aa  293  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  39.23 
 
 
446 aa  292  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  39.17 
 
 
445 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  36.99 
 
 
448 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  36.01 
 
 
450 aa  290  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  38.3 
 
 
435 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  38.53 
 
 
435 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  37.88 
 
 
435 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  37.88 
 
 
435 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  37.88 
 
 
435 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  37.88 
 
 
435 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  37.64 
 
 
435 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  37.64 
 
 
435 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  38.12 
 
 
431 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  38.35 
 
 
435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  37.33 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  37.33 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  37.33 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  34.3 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  38.95 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  37.13 
 
 
440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  38.64 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  37.11 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  38.21 
 
 
446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  38.76 
 
 
439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0397  Mg2+ and Co2+ transporter CorB family  36.06 
 
 
449 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  39.39 
 
 
444 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  38.21 
 
 
444 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  37.81 
 
 
443 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  36.19 
 
 
442 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  35.16 
 
 
453 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  37.1 
 
 
442 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  38.04 
 
 
443 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  37.1 
 
 
442 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  36.87 
 
 
442 aa  279  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  37.82 
 
 
443 aa  279  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  36.87 
 
 
442 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  37.67 
 
 
432 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  36.87 
 
 
442 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 
442 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  36.87 
 
 
442 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  37.5 
 
 
443 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  37.1 
 
 
442 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  37.67 
 
 
432 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  37.27 
 
 
443 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 
435 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  37.67 
 
 
432 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  37.67 
 
 
432 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  37.44 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.82 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.21 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  35.31 
 
 
440 aa  274  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  36.76 
 
 
432 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  36.53 
 
 
477 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  37.21 
 
 
441 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  38.62 
 
 
437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  34.58 
 
 
437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  33.9 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  32.95 
 
 
447 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  34.25 
 
 
446 aa  263  4e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  34.04 
 
 
443 aa  262  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  35.25 
 
 
442 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.64 
 
 
442 aa  260  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  41.09 
 
 
361 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  41.09 
 
 
361 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2361  hypothetical protein  34.27 
 
 
432 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00115702  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  34.77 
 
 
443 aa  259  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  37.24 
 
 
440 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  33.1 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  34.36 
 
 
443 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 
449 aa  251  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  33.26 
 
 
463 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  33.26 
 
 
463 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  36.9 
 
 
449 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  36.9 
 
 
449 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7616  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 
418 aa  249  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  32.1 
 
 
456 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  33.49 
 
 
428 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  32.62 
 
 
445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 
444 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3911  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 
418 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1548  hypothetical protein  39.43 
 
 
434 aa  246  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223592  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
439 aa  245  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
439 aa  245  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  34.38 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  34.88 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  33.89 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0022  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.19 
 
 
442 aa  244  3e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  33.89 
 
 
434 aa  243  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  36.41 
 
 
440 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  34.14 
 
 
465 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  34.2 
 
 
442 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>