More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1375 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  100 
 
 		 342 aa  691    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  68.53 
 
 		 345 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  65.03 
 
 		 359 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  68.55 
 
 		 345 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  64.29 
 
 		 350 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  64.53 
 
 		 384 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.87 
 
 		 349 aa  325  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.83 
 
 		 329 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.41 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  45.58 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.4 
 
 		 329 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.92 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  44.23 
 
 		 349 aa  318  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.69 
 
 		 348 aa  316  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.38 
 
 		 330 aa  316  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  48.76 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  47.35 
 
 		 341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  45.43 
 
 		 329 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  48.28 
 
 		 390 aa  308  9e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  47.2 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  47.16 
 
 		 407 aa  305  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  45.02 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  44.69 
 
 		 451 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.74 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  46.46 
 
 		 391 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  46.39 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  45.9 
 
 		 447 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  44.34 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.52 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  45.91 
 
 		 341 aa  295  1e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  44.38 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.71 
 
 		 354 aa  292  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  43.79 
 
 		 433 aa  292  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  43.06 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  46.36 
 
 		 472 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  43.88 
 
 		 447 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  45.63 
 
 		 466 aa  289  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  46.82 
 
 		 441 aa  288  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  45.63 
 
 		 486 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  43.81 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  43.65 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  44.16 
 
 		 449 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  45.09 
 
 		 420 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 		 410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  42.09 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  42.09 
 
 		 416 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.41 
 
 		 389 aa  284  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  42.09 
 
 		 416 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  42.09 
 
 		 416 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  44.75 
 
 		 458 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  44.03 
 
 		 438 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 		 369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.63 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  43.24 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  42.17 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.9 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  42.68 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  43.26 
 
 		 452 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  40.96 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  42.72 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  42.39 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  41.24 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  42.43 
 
 		 353 aa  276  5e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  42.04 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  45.89 
 
 		 333 aa  275  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  41.14 
 
 		 415 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  40.57 
 
 		 413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  42.6 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  44.41 
 
 		 417 aa  272  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  43.26 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  41.59 
 
 		 384 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  44.97 
 
 		 449 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4516  NADH dehydrogenase (quinone)  40.56 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.82 
 
 		 329 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  41 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  40.3 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  40.18 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.31 
 
 		 349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  45.16 
 
 		 319 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1693  NADH dehydrogenase subunit H  46.47 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  41.1 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  43.09 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.72 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  43.21 
 
 		 447 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3186  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.9 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  40.91 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.01 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  40.34 
 
 		 440 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0635  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.9 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.9 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  42.63 
 
 		 372 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  43.54 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  45.25 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  41.53 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.07 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  41.85 
 
 		 372 aa  265  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  44.3 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  44.3 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  44.3 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  40.36 
 
 		 372 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>