More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1354 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 472 aa  972    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  58.94 
 
 		 471 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  54.9 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  57.17 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  55.63 
 
 		 470 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  55.07 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  54.97 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  52.84 
 
 		 471 aa  517  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  56.58 
 
 		 467 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  53.59 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.66 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  43.51 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  43.51 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  42.67 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  42.42 
 
 		 459 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  42.42 
 
 		 459 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  42.42 
 
 		 459 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  39.87 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  38.84 
 
 		 461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  38.82 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  36.98 
 
 		 472 aa  299  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  35.84 
 
 		 455 aa  277  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 480 aa  269  8.999999999999999e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.79 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 617 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 		 471 aa  259  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  33.61 
 
 		 469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  31.97 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  36.03 
 
 		 456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  33.19 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 		 450 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  34.95 
 
 		 442 aa  243  7e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.98 
 
 		 478 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 466 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  32.48 
 
 		 478 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.27 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.48 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.27 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.48 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.01 
 
 		 478 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.69 
 
 		 478 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 478 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  32.02 
 
 		 457 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  32.42 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 		 453 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  32.19 
 
 		 470 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  33.11 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  31.98 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  30.79 
 
 		 450 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 480 aa  206  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32 
 
 		 470 aa  203  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.63 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  30.49 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 		 471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  29.05 
 
 		 446 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 476 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.09 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 489 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 470 aa  160  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 		 244 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  38.21 
 
 		 244 aa  144  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.22 
 
 		 243 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 		 243 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 		 243 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  33.88 
 
 		 246 aa  137  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  35.65 
 
 		 375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 		 243 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  36.36 
 
 		 251 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  38.03 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  27.99 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  27.15 
 
 		 346 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 		 378 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  32.07 
 
 		 397 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>