50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1334 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  316  6e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  203  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  56.95 
 
 		 167 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  54.67 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  56.29 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  53.38 
 
 		 156 aa  166  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  50.33 
 
 		 169 aa  164  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  53.1 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  50.67 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  48.3 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  44.44 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  48.32 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  42.36 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  40.13 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  39.26 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  37.84 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 		 501 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  40.82 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  38.1 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  42.72 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  32.7 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  29.7 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  30.71 
 
 		 492 aa  70.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  28.93 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  31.54 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  34.15 
 
 		 462 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  29.86 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  30.82 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  31.76 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  36.25 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  35.8 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  31.71 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  30.65 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  33.73 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  26.42 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  25.83 
 
 		 456 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  35.37 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  29.21 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  27.55 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  27.55 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>