More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1269 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  100 
 
 
348 aa  713    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 
374 aa  434  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  57.64 
 
 
357 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  56.82 
 
 
355 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  56.27 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  49.43 
 
 
351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  48.56 
 
 
349 aa  343  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  43.75 
 
 
373 aa  285  7e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  38.03 
 
 
447 aa  246  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  38.46 
 
 
356 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
401 aa  243  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  38.6 
 
 
410 aa  242  7.999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  36.86 
 
 
356 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  39.44 
 
 
371 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 
356 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
356 aa  235  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  36 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  36 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  37.04 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  35.9 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  36 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
365 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
365 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 
359 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  35.53 
 
 
354 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 
359 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  36.18 
 
 
359 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  37.04 
 
 
353 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  35.43 
 
 
362 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
357 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
359 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  36.23 
 
 
382 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  35.94 
 
 
382 aa  222  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  35.94 
 
 
382 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 
346 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  35.31 
 
 
356 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  35.9 
 
 
346 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  35.8 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  35.86 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  35.25 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  37.92 
 
 
370 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
351 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  36.64 
 
 
355 aa  209  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  35.54 
 
 
366 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  34.57 
 
 
346 aa  202  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  37.8 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  35.1 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  35.48 
 
 
370 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
360 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  35.49 
 
 
357 aa  195  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
363 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  33.75 
 
 
364 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
371 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.87 
 
 
364 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  37.95 
 
 
360 aa  192  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 
368 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  34.19 
 
 
344 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
356 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  36.27 
 
 
371 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
356 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  35.78 
 
 
368 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  32.68 
 
 
363 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
356 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
356 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
369 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
356 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
356 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
356 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  37.38 
 
 
364 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
356 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  36.83 
 
 
356 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  36.23 
 
 
356 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 
356 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
366 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  34.54 
 
 
358 aa  185  8e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
368 aa  185  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
357 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119523  Histidinol-phosphate aminotransferase, chloroplast precursor, probable  36.94 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  37.07 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  30.52 
 
 
383 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  35.38 
 
 
365 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
365 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  36.45 
 
 
357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  35.51 
 
 
352 aa  182  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 
396 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
375 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  34.74 
 
 
363 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
358 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
374 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  32.11 
 
 
401 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>