More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1226 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  100 
 
 
263 aa  540  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  31.77 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
207 aa  79  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.15 
 
 
207 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  34.78 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.85 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.89 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.42 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.59 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 
200 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.2 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.67 
 
 
230 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.54 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 
200 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  38.94 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.74 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.28 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.67 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  33.06 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.17 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  25.14 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  29.63 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35.4 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  36.19 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  37.38 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.77 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.14 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  30.71 
 
 
658 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.61 
 
 
205 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  26.42 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  35.24 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.26 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.59 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.79 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.85 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  37 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
364 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.19 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.45 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.45 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36.45 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.38 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  35.24 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>