145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1208 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  100 
 
 
1031 aa  2119    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  35.9 
 
 
546 aa  240  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  33.27 
 
 
556 aa  228  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  33.47 
 
 
556 aa  227  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  32.23 
 
 
556 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  31.65 
 
 
556 aa  220  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  30.38 
 
 
565 aa  213  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  30.46 
 
 
566 aa  204  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  30.45 
 
 
549 aa  204  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  28.38 
 
 
554 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  29.5 
 
 
566 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  34.39 
 
 
532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  28.79 
 
 
554 aa  202  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  28.95 
 
 
591 aa  202  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  29.14 
 
 
566 aa  202  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  29.14 
 
 
566 aa  202  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  30.23 
 
 
556 aa  201  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  33.7 
 
 
509 aa  200  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  33.7 
 
 
509 aa  200  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  29.97 
 
 
566 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  30.17 
 
 
591 aa  199  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  29.8 
 
 
566 aa  199  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  30.84 
 
 
549 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  28.15 
 
 
552 aa  197  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  29.97 
 
 
566 aa  197  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  30 
 
 
547 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  29.3 
 
 
566 aa  196  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  31.36 
 
 
591 aa  196  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  29.47 
 
 
566 aa  195  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  29.62 
 
 
566 aa  189  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  31.52 
 
 
507 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  31.51 
 
 
478 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0100  neutral protease, N-terminal region  45.74 
 
 
274 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0090986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  30.11 
 
 
924 aa  166  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3041  bacillolysin  37.4 
 
 
356 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0173986  normal  0.0722993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3392  bacillolysin  29.65 
 
 
565 aa  155  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000112359  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0380  neutral protease  29.07 
 
 
568 aa  154  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000306257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3170  neutral protease (bacillolysin)  29.84 
 
 
565 aa  153  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000070765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3176  thermolysin metallopeptidase, putative  38.46 
 
 
356 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  28.87 
 
 
984 aa  152  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3408  bacillolysin  29.84 
 
 
565 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3091  neutral protease (bacillolysin)  29.65 
 
 
565 aa  151  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000299935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  27.19 
 
 
891 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  28.3 
 
 
887 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8540  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  27.93 
 
 
889 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810503  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3189  neutral protease  29.46 
 
 
565 aa  148  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000741792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3442  neutral protease  29.46 
 
 
565 aa  148  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  28.01 
 
 
527 aa  148  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  27.01 
 
 
890 aa  147  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  28.68 
 
 
1154 aa  147  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2499  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  28.38 
 
 
567 aa  146  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000144667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2742  metalloendopeptidase  29.05 
 
 
567 aa  145  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00888041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  37.45 
 
 
360 aa  145  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  26.75 
 
 
891 aa  145  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2415  thermolysin  28.63 
 
 
567 aa  144  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000428909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2543  neutral protease  28.13 
 
 
567 aa  144  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000016311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2730  neutral protease  28.13 
 
 
567 aa  144  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  26.3 
 
 
886 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2464  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  28.05 
 
 
567 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  27.37 
 
 
884 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  27.62 
 
 
893 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  38.04 
 
 
342 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2738  metalloendopeptidase  27.94 
 
 
567 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.89181e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2787  metalloendopeptidase  28.83 
 
 
567 aa  142  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000221035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2551  metalloendopeptidase  28.03 
 
 
567 aa  138  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000846614  decreased coverage  0.0000000000277026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  37.21 
 
 
351 aa  135  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2537  peptidase M4, thermolysin  34.22 
 
 
348 aa  134  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  35.06 
 
 
1017 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  35.55 
 
 
375 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  35.16 
 
 
403 aa  132  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  33.11 
 
 
349 aa  131  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2762  neutral protease  32.02 
 
 
388 aa  131  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  35.12 
 
 
354 aa  130  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  30.26 
 
 
353 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  35.37 
 
 
350 aa  129  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  28.22 
 
 
498 aa  127  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  28.51 
 
 
498 aa  127  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  32.94 
 
 
356 aa  125  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2629  peptidase M4, thermolysin  37.68 
 
 
347 aa  123  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  27.2 
 
 
565 aa  122  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  26.76 
 
 
759 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  35.18 
 
 
341 aa  122  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  33.85 
 
 
347 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  38.61 
 
 
351 aa  122  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  33.07 
 
 
357 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  31 
 
 
347 aa  120  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1233  propeptide, peptidase M4 and M36  27.5 
 
 
565 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6599  propeptide, peptidase M4 and M36  27.5 
 
 
565 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6203  peptidase M4 thermolysin  27.5 
 
 
565 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231867  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  26.13 
 
 
775 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  28.41 
 
 
701 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03436  neutral protease A  38.5 
 
 
207 aa  116  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  27.35 
 
 
791 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  30.93 
 
 
565 aa  115  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  27.36 
 
 
609 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3836  propeptide, peptidase M4 and M36  27.08 
 
 
565 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827362  normal  0.318438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4301  peptidase M4 thermolysin  29.51 
 
 
565 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  26.53 
 
 
485 aa  109  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4056  peptidase M4, thermolysin  35.29 
 
 
430 aa  108  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  26.98 
 
 
780 aa  108  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>