156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1190 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1190  nuclease  100 
 
 		 166 aa  348  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  34.38 
 
 		 175 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  36.67 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  35.33 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  35.82 
 
 		 238 aa  91.7  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  34.85 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  35.56 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  34.42 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.21 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  35.22 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.88 
 
 		 174 aa  84  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  30.72 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  31.41 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.72 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  33.33 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.86 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.07 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  30.83 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  36.17 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34.65 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.55 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  33.1 
 
 		 227 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  34.62 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  33.08 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  32.56 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  29.68 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  26.53 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  26.44 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  28.14 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  26.8 
 
 		 244 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  33.1 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  31.01 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  27.04 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  33.59 
 
 		 208 aa  70.9  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.06 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  33.09 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  28.66 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  29.58 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  27.63 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  27.67 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  28.68 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.41 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  29.73 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  29.5 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.9 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  29.37 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  27.33 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  27.74 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  28.67 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  24.86 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  26.88 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  25.31 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  26.59 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  28.47 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  28.89 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  29.63 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  31.75 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  26.83 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30.3 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30.3 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  26.67 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  28.47 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  31.15 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  26.8 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  29.63 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  30.08 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  27.83 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  30.37 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  26.03 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  29.63 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  29.75 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  23.63 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  28.48 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  26.71 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  30.34 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  28.48 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  27.91 
 
 		 350 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  29.59 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  34.42 
 
 		 534 aa  51.6  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  25.35 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  25.88 
 
 		 249 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  23.44 
 
 		 388 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  28.12 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  30.7 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  28.12 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  28.12 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  29.73 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  25.43 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  29.25 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  29.01 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  30.25 
 
 		 241 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  27.86 
 
 		 221 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  25.93 
 
 		 233 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  24.5 
 
 		 187 aa  47.4  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  29.37 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  37.36 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  29.75 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  25.45 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>