More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1132 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  100 
 
 		 355 aa  709    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.92 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.14 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  51.55 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.74 
 
 		 348 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.02 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  57.48 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  55.56 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0463  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  58.68 
 
 		 403 aa  149  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.71 
 
 		 365 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 216 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.63 
 
 		 236 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  56.56 
 
 		 589 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  52.8 
 
 		 196 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4447  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 204 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  53.39 
 
 		 247 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 288 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  49.6 
 
 		 265 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 1341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  47.97 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 248 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 248 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  30.24 
 
 		 251 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 248 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 251 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.24 
 
 		 248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 630 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 251 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.01 
 
 		 218 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.2 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.69 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.69 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 225 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.85 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 225 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 		 257 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 993 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.86 
 
 		 235 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  45.6 
 
 		 1278 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_002950  PG0396  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 232 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.27 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 		 247 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 225 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 263 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  39.13 
 
 		 414 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 224 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 224 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2657  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 128 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0140925  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  34.97 
 
 		 1311 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.11 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.11 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 		 228 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 232 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 212 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.96 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.96 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 215 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 225 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 225 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 137 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 245 aa  99.4  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 225 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 217 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.25 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  43.41 
 
 		 247 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.06 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.41 
 
 		 246 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.83 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.83 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  43.44 
 
 		 235 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  43.65 
 
 		 249 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  39.66 
 
 		 1378 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  43.8 
 
 		 403 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 		 228 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 234 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.23 
 
 		 310 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4388  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 227 aa  97.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 		 403 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  42.5 
 
 		 234 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 245 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 234 aa  97.1  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  37.84 
 
 		 242 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 228 aa  96.7  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  43.2 
 
 		 1373 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>