143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1101 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  100 
 
 
911 aa  1845    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.06 
 
 
821 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.24 
 
 
818 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  40.06 
 
 
2082 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  32.09 
 
 
807 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  39.94 
 
 
717 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  38.53 
 
 
714 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  37.31 
 
 
784 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  31.28 
 
 
743 aa  347  8.999999999999999e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  36.46 
 
 
792 aa  338  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  36.75 
 
 
778 aa  333  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  36.5 
 
 
776 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.97 
 
 
1679 aa  313  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.04 
 
 
837 aa  307  7e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  43.24 
 
 
461 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.48 
 
 
1919 aa  282  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  42.06 
 
 
461 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.33 
 
 
1126 aa  266  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  42.64 
 
 
547 aa  239  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  40.69 
 
 
449 aa  234  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  38.82 
 
 
1129 aa  221  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.36 
 
 
469 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.53 
 
 
554 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.35 
 
 
563 aa  195  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  36.07 
 
 
477 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.05 
 
 
561 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.26 
 
 
1848 aa  192  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.48 
 
 
417 aa  191  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  35.38 
 
 
569 aa  190  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  36.03 
 
 
558 aa  188  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
570 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  34.22 
 
 
560 aa  185  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  36.86 
 
 
553 aa  185  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.03 
 
 
555 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.71 
 
 
567 aa  184  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  26.85 
 
 
1222 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  38.65 
 
 
577 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  40.5 
 
 
376 aa  181  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  36.46 
 
 
835 aa  178  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  35.21 
 
 
579 aa  178  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  32.25 
 
 
363 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  32.25 
 
 
363 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  31.95 
 
 
593 aa  176  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  35.36 
 
 
558 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.87 
 
 
692 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  35.58 
 
 
726 aa  173  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  35.21 
 
 
551 aa  173  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.19 
 
 
556 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  35.58 
 
 
546 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  33.83 
 
 
554 aa  172  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.31 
 
 
555 aa  172  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  33.67 
 
 
737 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  33.85 
 
 
681 aa  165  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  27.78 
 
 
1187 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.97 
 
 
706 aa  163  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  33.58 
 
 
443 aa  158  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  35.8 
 
 
403 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.39 
 
 
553 aa  154  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  26 
 
 
1207 aa  154  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  28.43 
 
 
575 aa  145  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  35.05 
 
 
389 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  35.69 
 
 
566 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32 
 
 
810 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.36 
 
 
921 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  31.62 
 
 
900 aa  126  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  29.87 
 
 
597 aa  124  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.25 
 
 
728 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.81 
 
 
787 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  27.81 
 
 
396 aa  119  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  30.6 
 
 
638 aa  118  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
745 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  27.49 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.42 
 
 
817 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  32.6 
 
 
618 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  33.33 
 
 
332 aa  109  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.11 
 
 
941 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  28.77 
 
 
544 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.05 
 
 
535 aa  105  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  27.73 
 
 
418 aa  100  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  29.76 
 
 
602 aa  99.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  24.42 
 
 
727 aa  97.8  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  27.33 
 
 
624 aa  96.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  26.85 
 
 
328 aa  95.5  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  29.03 
 
 
450 aa  94  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.53 
 
 
1147 aa  93.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.27 
 
 
454 aa  89.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  26.03 
 
 
371 aa  89.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  26.42 
 
 
643 aa  88.6  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  29.79 
 
 
298 aa  88.6  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  26.97 
 
 
547 aa  87.8  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  24.01 
 
 
375 aa  88.2  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  22.36 
 
 
657 aa  87.8  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  28.37 
 
 
390 aa  87.4  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  26.68 
 
 
447 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  26.83 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  28.13 
 
 
1312 aa  85.5  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  26.88 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.56 
 
 
2816 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  42.53 
 
 
106 aa  82.4  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  24.57 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>