253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0997 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0997  dienelactone hydrolase-related protein  100 
 
 
285 aa  583  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  44.73 
 
 
292 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  32.44 
 
 
290 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 
290 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
292 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  30.4 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  32.9 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.53 
 
 
227 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
224 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  31.58 
 
 
224 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  30.3 
 
 
224 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 
246 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  29.15 
 
 
243 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  33.02 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  32.41 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
237 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  27.62 
 
 
238 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  27.62 
 
 
238 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
237 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
237 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  31.86 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
237 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  31.73 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  27.59 
 
 
236 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  29.11 
 
 
237 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  28.07 
 
 
227 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  31.63 
 
 
263 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  31.33 
 
 
262 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
237 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  31.16 
 
 
265 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  28.38 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
238 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  32.56 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
238 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  29.61 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  26.05 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  27.73 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  26.52 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  29.79 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  31.18 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  31.84 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  28.3 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  27.03 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  30.56 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  25.64 
 
 
227 aa  77  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  29.02 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  25.21 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  27.92 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  28 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  31.87 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  27.95 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  31.44 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  27.07 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  24.66 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  26.17 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  28 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  27.1 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  24.79 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  27.06 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  25.76 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  25.63 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  29.78 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  26.32 
 
 
240 aa  62.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  26.96 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  26.76 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  29.21 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  27.68 
 
 
238 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  27.68 
 
 
238 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  27.2 
 
 
291 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  25 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
407 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  22.14 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  24.37 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  29.19 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  23.28 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  26.16 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  27.93 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  26.32 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  25.62 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  26.32 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  28.05 
 
 
245 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  28.8 
 
 
279 aa  55.8  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  36.26 
 
 
313 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  22.51 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  25.78 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  23.01 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  26.02 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  26.59 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  26.44 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  26.7 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  27.95 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  26.61 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>