More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0995 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 361 aa  749    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  48.63 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  47.86 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  34.44 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  35.8 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  31.52 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  29.21 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  26.98 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  28.61 
 
 		 357 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  28 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  28.49 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  27.47 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  27.4 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  25.2 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  30.14 
 
 		 377 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  26.57 
 
 		 382 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  26.91 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  26.09 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  28.23 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  26.16 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  26.61 
 
 		 377 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  27.42 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  27.55 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  24.73 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  26.36 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  27.95 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  25.63 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  25.98 
 
 		 395 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  26.7 
 
 		 357 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  25 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  24.44 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  24.44 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  24.86 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  25.92 
 
 		 374 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  24.72 
 
 		 370 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  25.49 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  23.53 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  25.35 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  24.86 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  26.05 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  25.33 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  26.03 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  25.86 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  25.42 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  24.18 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  25.42 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  25.42 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  25.49 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  24.65 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  24.79 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  26.46 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  23.81 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  24.38 
 
 		 417 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  27.81 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  23.97 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  24.16 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  30.23 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.09 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  23.2 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  24.73 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  29.44 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  28.06 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  29.68 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  26.57 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  28.44 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  24.38 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  26.09 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  23.16 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  22.78 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  27.5 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  27.19 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  29.22 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  27.4 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  29.63 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  28.77 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  27.83 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  26.27 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  28.11 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  27.52 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  23.43 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  23.58 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.27 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  27.24 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  24.36 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2443  phosphoserine aminotransferase  27.53 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  24.8 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  26.58 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  28.97 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  23.06 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  22.95 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  25.98 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  26.69 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  25.81 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  26.95 
 
 		 421 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  25.46 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  28.62 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  27.17 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  30.37 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  27.19 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  26.32 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>