More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0894 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  100 
 
 
380 aa  774    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3893  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
374 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 
399 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
364 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
389 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  31.07 
 
 
378 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
380 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  33.95 
 
 
383 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
403 aa  143  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
770 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
379 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
376 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  27.89 
 
 
388 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
408 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
376 aa  106  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
359 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
409 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
376 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
390 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
374 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  26.87 
 
 
399 aa  99.4  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
370 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  28.63 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
423 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
382 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  31.72 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  33.66 
 
 
351 aa  92.8  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  28.16 
 
 
385 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
378 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
377 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
385 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
387 aa  89.7  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.51 
 
 
396 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
429 aa  89.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 
377 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5045  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  30.08 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
391 aa  87  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
406 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
366 aa  86.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.09 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
426 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
477 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
391 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 
634 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  24.44 
 
 
770 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>