More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0880 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  100 
 
 		 786 aa  1600    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  34.43 
 
 		 800 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  34.2 
 
 		 815 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  31.79 
 
 		 815 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  32 
 
 		 798 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  31.01 
 
 		 783 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  30.27 
 
 		 775 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  30.52 
 
 		 767 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  30.68 
 
 		 802 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  30.66 
 
 		 772 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  30.66 
 
 		 795 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  27.81 
 
 		 794 aa  323  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  28.25 
 
 		 759 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  30.44 
 
 		 796 aa  314  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  28.4 
 
 		 784 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  28.53 
 
 		 822 aa  290  6e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  28.23 
 
 		 753 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 804 aa  243  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  29.04 
 
 		 790 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  24.79 
 
 		 767 aa  223  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  27.06 
 
 		 806 aa  206  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.06 
 
 		 756 aa  190  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  23.91 
 
 		 800 aa  181  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  22.68 
 
 		 735 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  24.84 
 
 		 716 aa  177  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  23.65 
 
 		 734 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  22.4 
 
 		 740 aa  173  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  25.1 
 
 		 820 aa  172  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.32 
 
 		 739 aa  171  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  24.65 
 
 		 740 aa  170  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.65 
 
 		 722 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.77 
 
 		 736 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30.05 
 
 		 739 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30.05 
 
 		 739 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  34.24 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  29.79 
 
 		 739 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  23.69 
 
 		 753 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  21.3 
 
 		 726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  23.63 
 
 		 734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.66 
 
 		 743 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  26.62 
 
 		 749 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  24.47 
 
 		 803 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 730 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  22.99 
 
 		 722 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  23.82 
 
 		 755 aa  164  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  24.52 
 
 		 721 aa  164  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  25.2 
 
 		 790 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  20.23 
 
 		 736 aa  163  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.83 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  40.28 
 
 		 232 aa  160  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  27.96 
 
 		 740 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  24.21 
 
 		 803 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  27.84 
 
 		 779 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  21.82 
 
 		 723 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.67 
 
 		 741 aa  158  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  22.25 
 
 		 720 aa  158  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.91 
 
 		 730 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  28.65 
 
 		 732 aa  157  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 738 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  28.25 
 
 		 741 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.25 
 
 		 741 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.19 
 
 		 750 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.17 
 
 		 726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28 
 
 		 741 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  28 
 
 		 741 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.12 
 
 		 726 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  28 
 
 		 741 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.75 
 
 		 741 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  22.83 
 
 		 745 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.82 
 
 		 496 aa  154  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  37.56 
 
 		 484 aa  154  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.97 
 
 		 225 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.65 
 
 		 746 aa  154  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.9 
 
 		 736 aa  154  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  23.77 
 
 		 747 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.67 
 
 		 734 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  36.53 
 
 		 233 aa  153  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  25.85 
 
 		 742 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25 
 
 		 720 aa  152  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.65 
 
 		 741 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  22.15 
 
 		 720 aa  153  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  22.02 
 
 		 720 aa  152  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  22.24 
 
 		 720 aa  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  36.07 
 
 		 233 aa  151  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  30.16 
 
 		 721 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  22.37 
 
 		 720 aa  151  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  22.37 
 
 		 720 aa  151  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  22.02 
 
 		 720 aa  151  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  36.53 
 
 		 233 aa  150  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  22.27 
 
 		 720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  23.37 
 
 		 759 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  22.73 
 
 		 753 aa  150  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  22.27 
 
 		 720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  34.98 
 
 		 615 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  21.91 
 
 		 724 aa  150  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  37.56 
 
 		 225 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.12 
 
 		 240 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  36.07 
 
 		 233 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  21.94 
 
 		 747 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  26.55 
 
 		 772 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>