26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0801 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  100 
 
 		 397 aa  829    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  43.25 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  41.12 
 
 		 487 aa  333  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  42.42 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  43.41 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  40.36 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  43.07 
 
 		 407 aa  315  9e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  43.07 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  42.46 
 
 		 407 aa  311  9e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  42.46 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  40.05 
 
 		 495 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  40.49 
 
 		 518 aa  307  3e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  40.18 
 
 		 580 aa  300  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  41.07 
 
 		 484 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  40.93 
 
 		 484 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  37.31 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  39.8 
 
 		 457 aa  277  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  40 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  39.65 
 
 		 456 aa  269  7e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  38.48 
 
 		 457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  39.04 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  38.17 
 
 		 444 aa  244  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  34.72 
 
 		 448 aa  224  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  26.89 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  27.51 
 
 		 490 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>