More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0800 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 622 aa  1266    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  47.48 
 
 		 630 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 630 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  46.71 
 
 		 622 aa  581  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  46.07 
 
 		 621 aa  561  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  45.51 
 
 		 620 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  46.72 
 
 		 634 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 623 aa  535  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  43.48 
 
 		 620 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  41.68 
 
 		 642 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  41.37 
 
 		 642 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  42.3 
 
 		 642 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  40.91 
 
 		 632 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  40.66 
 
 		 630 aa  485  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  40.72 
 
 		 639 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  40.34 
 
 		 653 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 629 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  41.68 
 
 		 631 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  41.54 
 
 		 632 aa  480  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 629 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  40.82 
 
 		 626 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 631 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 631 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 631 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 631 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  41.36 
 
 		 631 aa  475  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 631 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 		 631 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  41.36 
 
 		 631 aa  475  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 631 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  40.95 
 
 		 630 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  40.8 
 
 		 643 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  42.77 
 
 		 630 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  41.43 
 
 		 631 aa  465  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  40.62 
 
 		 640 aa  459  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  41.02 
 
 		 631 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 642 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  41.74 
 
 		 642 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  41.89 
 
 		 646 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  38.11 
 
 		 636 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  39.06 
 
 		 613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  41.03 
 
 		 641 aa  445  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  38.27 
 
 		 641 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  38.58 
 
 		 641 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 622 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  42.86 
 
 		 723 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  37.21 
 
 		 633 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  38.02 
 
 		 644 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  37.03 
 
 		 625 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  39.87 
 
 		 626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  37.3 
 
 		 636 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 627 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  38.81 
 
 		 631 aa  402  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 		 652 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  36.81 
 
 		 625 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  36.81 
 
 		 625 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 		 556 aa  392  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  37.07 
 
 		 679 aa  383  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  35.91 
 
 		 626 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  36.76 
 
 		 633 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.92 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  37.76 
 
 		 634 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  35 
 
 		 632 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  37.33 
 
 		 642 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 632 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  37.46 
 
 		 623 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  35.67 
 
 		 656 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 		 654 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 559 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  35.85 
 
 		 649 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  35.94 
 
 		 649 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  35.94 
 
 		 649 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  35.23 
 
 		 688 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 648 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 648 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 648 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 660 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  35.69 
 
 		 661 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 648 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  35.69 
 
 		 661 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 		 563 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 1065 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  35.04 
 
 		 641 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  36.03 
 
 		 628 aa  365  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 560 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  35.54 
 
 		 650 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 		 563 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  36.12 
 
 		 641 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  35.89 
 
 		 628 aa  365  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 		 560 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  36.49 
 
 		 663 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  35.75 
 
 		 654 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  36.45 
 
 		 636 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.22 
 
 		 559 aa  362  9e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  34.72 
 
 		 649 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  34.59 
 
 		 629 aa  362  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 555 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  34.31 
 
 		 644 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>