158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0799 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  100 
 
 
461 aa  922    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  40.65 
 
 
461 aa  360  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.58 
 
 
1679 aa  343  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.51 
 
 
821 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.24 
 
 
818 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  40.29 
 
 
911 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.83 
 
 
1919 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  40.49 
 
 
807 aa  265  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  36.2 
 
 
547 aa  252  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  37.02 
 
 
2082 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  41.3 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  38 
 
 
778 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  38.31 
 
 
717 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  37.82 
 
 
792 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  36.39 
 
 
784 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  36.9 
 
 
714 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.57 
 
 
556 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  37.36 
 
 
1129 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  34.96 
 
 
593 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  35.53 
 
 
776 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  30.85 
 
 
743 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.81 
 
 
561 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  34.19 
 
 
558 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.16 
 
 
554 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.62 
 
 
692 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.61 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  34.75 
 
 
477 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  35.43 
 
 
835 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.33 
 
 
837 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  29.87 
 
 
553 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  31.64 
 
 
579 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.55 
 
 
417 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  31.85 
 
 
551 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.42 
 
 
563 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  38.79 
 
 
376 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  31.22 
 
 
560 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.38 
 
 
555 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  31.51 
 
 
569 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.45 
 
 
1848 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  32.3 
 
 
726 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.72 
 
 
555 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.52 
 
 
706 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  31.65 
 
 
546 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.09 
 
 
567 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  34.15 
 
 
737 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  29.61 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  29.61 
 
 
363 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  32.09 
 
 
577 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.14 
 
 
553 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.02 
 
 
900 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  30.66 
 
 
566 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.32 
 
 
570 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  29.7 
 
 
554 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  33.53 
 
 
681 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  28.78 
 
 
558 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  34.71 
 
 
389 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  32.96 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.11 
 
 
1126 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  51.97 
 
 
1222 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.9 
 
 
810 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  28.03 
 
 
575 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  29.68 
 
 
597 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28.35 
 
 
443 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  27.35 
 
 
341 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  25.07 
 
 
728 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  34.25 
 
 
638 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  25.15 
 
 
396 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
745 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  34.76 
 
 
618 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  29.54 
 
 
328 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  28.31 
 
 
1207 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.55 
 
 
787 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  26.93 
 
 
1187 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.39 
 
 
941 aa  97.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  26.78 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.63 
 
 
817 aa  93.2  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  27.16 
 
 
624 aa  90.5  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.27 
 
 
921 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.65 
 
 
454 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.13 
 
 
1147 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.25 
 
 
535 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  26.48 
 
 
332 aa  86.7  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  27.47 
 
 
544 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  25.59 
 
 
643 aa  84  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  27.83 
 
 
602 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  26.59 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  23.83 
 
 
558 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  25.95 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3336  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein  28.77 
 
 
787 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0329371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  28.18 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  23.26 
 
 
643 aa  77  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  24.44 
 
 
533 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  21.53 
 
 
657 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  22.05 
 
 
727 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  27.73 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  26.3 
 
 
2816 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.32 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  28.92 
 
 
1312 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  22.75 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  29.06 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>