More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0754 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
169 aa  357  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2423  methionine sulfoxide reductase B  72.17 
 
 
122 aa  188  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55047  normal  0.248958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  63.19 
 
 
159 aa  186  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.33 
 
 
334 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  70.43 
 
 
290 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.52 
 
 
338 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.38 
 
 
284 aa  179  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.26 
 
 
301 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.26 
 
 
301 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.26 
 
 
301 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  69.57 
 
 
119 aa  176  9e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.37 
 
 
301 aa  177  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.1 
 
 
334 aa  176  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  68.7 
 
 
119 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  69.57 
 
 
119 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.57 
 
 
305 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.14 
 
 
301 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.49 
 
 
301 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.49 
 
 
301 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.49 
 
 
302 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.81 
 
 
351 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  65.52 
 
 
124 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.04 
 
 
301 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2731  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  69.57 
 
 
120 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000598889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.54 
 
 
333 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.6 
 
 
301 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  69.64 
 
 
306 aa  169  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.6 
 
 
305 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.96 
 
 
301 aa  167  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  62.07 
 
 
124 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.48 
 
 
300 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  62.61 
 
 
121 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.96 
 
 
309 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.54 
 
 
287 aa  164  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.61 
 
 
286 aa  160  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1329  Methionine sulfoxide reductase B  58.93 
 
 
148 aa  153  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.397039  normal  0.253282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.93 
 
 
289 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.04 
 
 
289 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.46 
 
 
284 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.46 
 
 
284 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  49.23 
 
 
136 aa  131  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  49.24 
 
 
136 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  48.12 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  48.12 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  48.12 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  52.17 
 
 
148 aa  127  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  47.69 
 
 
136 aa  124  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  52.17 
 
 
136 aa  124  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  47.69 
 
 
146 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  46.15 
 
 
146 aa  120  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  42.34 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  50.88 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  48.25 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  41.61 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  43.85 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  47.46 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  40.82 
 
 
161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  48.72 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  36.88 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  49.57 
 
 
140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  45.61 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  46.96 
 
 
137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9083  predicted protein  49.09 
 
 
128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  42.86 
 
 
171 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  45.74 
 
 
153 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  44.09 
 
 
133 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  47.79 
 
 
131 aa  107  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  47.46 
 
 
142 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  45.69 
 
 
133 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  43.48 
 
 
148 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  44.07 
 
 
133 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  46.72 
 
 
134 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  44.74 
 
 
136 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  47.46 
 
 
130 aa  105  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  41.13 
 
 
138 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  35.71 
 
 
184 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  42.52 
 
 
148 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1972  methionine-R-sulfoxide reductase  40.58 
 
 
156 aa  104  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  46.09 
 
 
142 aa  104  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  44.96 
 
 
159 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  44.8 
 
 
142 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  39.33 
 
 
154 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  46.22 
 
 
133 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  47.9 
 
 
134 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  44.83 
 
 
133 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  40.15 
 
 
147 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  39.29 
 
 
137 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  44.63 
 
 
135 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  38.89 
 
 
144 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  44.63 
 
 
139 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  42.52 
 
 
133 aa  102  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  44.63 
 
 
139 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  43.59 
 
 
134 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  49.57 
 
 
144 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  40 
 
 
147 aa  101  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01932  methionine-R-sulfoxide reductase SelR, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07840)  54.35 
 
 
153 aa  101  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  39.07 
 
 
180 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  49.58 
 
 
137 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  45.3 
 
 
127 aa  101  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  47.32 
 
 
136 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>