More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0723 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  100 
 
 		 454 aa  906    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  41.18 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  40.55 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  38.83 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  32.59 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  36.36 
 
 		 466 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  35.56 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  34.01 
 
 		 442 aa  246  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  32.44 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.49 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  35.82 
 
 		 451 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  32.75 
 
 		 460 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  31.28 
 
 		 477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  31.28 
 
 		 477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  31.46 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  31.13 
 
 		 461 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  31.47 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  29.89 
 
 		 456 aa  209  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  31.71 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  29.96 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  28.85 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  29.61 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  31.64 
 
 		 457 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  31.64 
 
 		 457 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  31.64 
 
 		 457 aa  203  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  30.97 
 
 		 486 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  28.48 
 
 		 454 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  31.19 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  29.01 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  29.86 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  28.82 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  28.82 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  28.64 
 
 		 465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  29.64 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  28.82 
 
 		 453 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  30.89 
 
 		 457 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  30.25 
 
 		 458 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  30.89 
 
 		 457 aa  199  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  31.03 
 
 		 464 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  28.86 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  28.82 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  30.67 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  28.93 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  30.6 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  30.67 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  30.67 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  31.04 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  30.67 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  30.45 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  28.73 
 
 		 453 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  31.07 
 
 		 472 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1117  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 483 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  30.82 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  30.82 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  30.82 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  31.59 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  30.82 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  30.82 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  28.28 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  29.89 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  31.04 
 
 		 453 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  29.89 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  29.89 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  31.99 
 
 		 470 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  29.89 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 470 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  31.22 
 
 		 480 aa  193  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 453 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  30.81 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  29.89 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  28.63 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  30.72 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  28.28 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 451 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  28.83 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  31.07 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 463 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 462 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 467 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  29.19 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 462 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  30.73 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  29.56 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  29.82 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 478 aa  187  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  29.33 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  29.19 
 
 		 452 aa  186  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  30.16 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  30.82 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  31.49 
 
 		 470 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  30.39 
 
 		 474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 475 aa  183  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>