24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0700 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  300  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  43.92 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  39.71 
 
 
151 aa  122  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  44.3 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  38.46 
 
 
156 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  37.86 
 
 
438 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  38.97 
 
 
158 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  41.01 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  33.8 
 
 
326 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  38.57 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  39.6 
 
 
314 aa  88.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  38.19 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  35.62 
 
 
163 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  34.53 
 
 
144 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  37.14 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  36.11 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  30.08 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  31.58 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  40 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  37.61 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  29.85 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  26.12 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  37.25 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  29.13 
 
 
473 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>