77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0566 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  60.99 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1322  DoxX  49.29 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  42.14 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13521  hypothetical protein  44.37 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  38.46 
 
 		 161 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  28.1 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  34.78 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  27.5 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  28.03 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  37.65 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  37.35 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  35.9 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  31.75 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  29.75 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  47.73 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  32.93 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  32.03 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  28.48 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  30.95 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  46.81 
 
 		 198 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  32.93 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  26.95 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  32.93 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  29.92 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  27.86 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  25.35 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  47.73 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  26.87 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  39.66 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  30.3 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  28.69 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  33.73 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  27.89 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  27.07 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  40.28 
 
 		 199 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  26.28 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  31.25 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  26.32 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  28.33 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  26.67 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  38 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  25.69 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  25.85 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  31.71 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  29.23 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  28.47 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  30.08 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  27.56 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  31.52 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  26.85 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  30.33 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  31.2 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  28.06 
 
 		 145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  28.38 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  28.38 
 
 		 185 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  28.06 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  36.25 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  36.25 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  29.2 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  36 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  25.9 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  24.31 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  32.67 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  28.06 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  27.78 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  29.08 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  27.27 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  30.12 
 
 		 183 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  40.91 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  30.12 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  29.13 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  26.83 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  27.01 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  24.66 
 
 		 135 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  27.01 
 
 		 137 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>