More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0564 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  345  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  53.25 
 
 		 189 aa  186  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  52.3 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  48.81 
 
 		 190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  48.31 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  44.31 
 
 		 189 aa  148  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  43.68 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  43.27 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  43.27 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  41.86 
 
 		 174 aa  127  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  38.6 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  39.77 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  39.77 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  34.29 
 
 		 179 aa  120  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  39.31 
 
 		 214 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  36.42 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  36.84 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  39.16 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  36.42 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  35.76 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  35.58 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  39.58 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  38.62 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  38.1 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  36.88 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  37.36 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  35.63 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  32.73 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  36.78 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  37.58 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  37.43 
 
 		 223 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  37.43 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  35.8 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  37.43 
 
 		 201 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  33.52 
 
 		 182 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  39.88 
 
 		 190 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.21 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  37.5 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  39.88 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  38.69 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  39.88 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  34.3 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  37.14 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  31.58 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.43 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  36.14 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  32.75 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  34.5 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.92 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  31.58 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  38.89 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  32.52 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  36.36 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  34.83 
 
 		 181 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  31.9 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  33.56 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  34.03 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  35.39 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  36.9 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  36.24 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  33.33 
 
 		 213 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  33.14 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  32.75 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  31.9 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  31.64 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  31.9 
 
 		 202 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  38.03 
 
 		 285 aa  99  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  29.94 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  33.52 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  33.52 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  33.52 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  33.14 
 
 		 187 aa  98.6  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  32.16 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  33.92 
 
 		 196 aa  97.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  33.13 
 
 		 205 aa  97.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  35.06 
 
 		 197 aa  97.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  31.9 
 
 		 199 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  37.67 
 
 		 181 aa  97.4  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  33.13 
 
 		 237 aa  97.4  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  35.06 
 
 		 197 aa  97.4  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  36.81 
 
 		 182 aa  97.4  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  97.1  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  34.36 
 
 		 235 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  34.71 
 
 		 209 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  35.53 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  34.48 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  34.69 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  34.29 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  34.73 
 
 		 189 aa  95.5  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  38.24 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  37.5 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  32.37 
 
 		 201 aa  95.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  33.14 
 
 		 207 aa  94.7  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  28.16 
 
 		 220 aa  95.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  35.42 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  32.56 
 
 		 207 aa  94.4  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  33.72 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  32.35 
 
 		 254 aa  94.4  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  32.41 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>