More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0523 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  100 
 
 		 343 aa  719    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  49.3 
 
 		 357 aa  293  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  48.67 
 
 		 365 aa  279  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  37.39 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  42.14 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  38.3 
 
 		 398 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  36.31 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  36.74 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  35.14 
 
 		 401 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  41.75 
 
 		 311 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  38.35 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  38.26 
 
 		 359 aa  212  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  35.87 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  38.19 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  41.18 
 
 		 768 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  35.88 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  38.7 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  37.15 
 
 		 626 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  37.21 
 
 		 395 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  37.35 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  34.35 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  37.99 
 
 		 369 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  39.1 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  36.65 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  35.82 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  36.56 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  37.06 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  35.43 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  35.8 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  37.21 
 
 		 594 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  35.74 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  35.03 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  36.14 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  37.05 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  35.25 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  34.59 
 
 		 521 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  36.13 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  34.37 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  36.51 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  34.63 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  33.43 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  37.37 
 
 		 371 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  35.03 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  35.92 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  37.11 
 
 		 417 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  35.48 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  35.21 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  35.59 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 		 352 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  38.17 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  35.61 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  34.89 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  36.73 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  36.24 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  34.41 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  35.56 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.81 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  35.97 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  39.52 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  35.11 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  35.11 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  35.11 
 
 		 459 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  36.9 
 
 		 464 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  34.13 
 
 		 342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  32.32 
 
 		 349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  34.7 
 
 		 592 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  33.54 
 
 		 346 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  36.15 
 
 		 459 aa  162  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  35.31 
 
 		 473 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  32.33 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  34.97 
 
 		 616 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  34.52 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  34.24 
 
 		 401 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  38.06 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  36.29 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  34.81 
 
 		 346 aa  159  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  31.23 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  35.14 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  33.69 
 
 		 333 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  33.69 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  33.69 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  33.69 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  34.41 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  34.63 
 
 		 333 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  36.84 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  34.38 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  34.33 
 
 		 626 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  34.47 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  34.47 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  32.09 
 
 		 571 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  32.79 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  34.47 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  36.51 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>