213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0399 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  56.59 
 
 		 593 aa  701    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  100 
 
 		 593 aa  1246    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  57.05 
 
 		 594 aa  714    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  39.29 
 
 		 593 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  39.97 
 
 		 595 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  39.76 
 
 		 593 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  38.15 
 
 		 620 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  37.63 
 
 		 624 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  38.58 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  39.26 
 
 		 595 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  37.44 
 
 		 603 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  36.54 
 
 		 598 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  38.66 
 
 		 592 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  37.44 
 
 		 596 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  37.93 
 
 		 606 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  37.93 
 
 		 606 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  37.12 
 
 		 598 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  36.95 
 
 		 597 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  36.94 
 
 		 657 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  37.21 
 
 		 597 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  37.8 
 
 		 606 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  36.27 
 
 		 599 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  37.27 
 
 		 640 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  37.65 
 
 		 618 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  37.39 
 
 		 598 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  34.97 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  37.1 
 
 		 594 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  34.25 
 
 		 612 aa  332  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 613 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  32.63 
 
 		 612 aa  324  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  33.93 
 
 		 596 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  34.52 
 
 		 602 aa  313  6.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  33.45 
 
 		 601 aa  313  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  31.86 
 
 		 586 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  32.88 
 
 		 625 aa  303  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  32.72 
 
 		 600 aa  303  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  32.61 
 
 		 617 aa  303  9e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  31.25 
 
 		 606 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  33.22 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  32.2 
 
 		 598 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  31.58 
 
 		 665 aa  300  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  31.72 
 
 		 610 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 		 610 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  32.72 
 
 		 626 aa  300  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  31.72 
 
 		 610 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  31.72 
 
 		 610 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  31.72 
 
 		 610 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  31.72 
 
 		 610 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  31.72 
 
 		 610 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  32.99 
 
 		 598 aa  299  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  33 
 
 		 627 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  32.5 
 
 		 602 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  31.4 
 
 		 626 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  32.5 
 
 		 602 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  33.01 
 
 		 623 aa  297  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  31.62 
 
 		 609 aa  297  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  32.03 
 
 		 610 aa  297  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  32.29 
 
 		 602 aa  297  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  32.89 
 
 		 605 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 605 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  31.95 
 
 		 599 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  31.94 
 
 		 603 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  33.01 
 
 		 623 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  31.79 
 
 		 609 aa  293  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  30.56 
 
 		 594 aa  292  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  31.52 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  31.52 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  31.67 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  31.09 
 
 		 617 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  30.96 
 
 		 609 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  32.05 
 
 		 613 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  31.13 
 
 		 611 aa  290  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  32.14 
 
 		 619 aa  289  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  31.35 
 
 		 609 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  30.82 
 
 		 613 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  32.34 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  30.7 
 
 		 619 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  32.14 
 
 		 599 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  31.45 
 
 		 600 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  30.94 
 
 		 594 aa  286  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  32.16 
 
 		 611 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  31.5 
 
 		 608 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  31.53 
 
 		 596 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  31.25 
 
 		 594 aa  277  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  31.04 
 
 		 635 aa  276  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  31.33 
 
 		 627 aa  276  9e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  30.63 
 
 		 850 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  31.09 
 
 		 619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  31.09 
 
 		 619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  31.22 
 
 		 596 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  31.17 
 
 		 620 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  31.56 
 
 		 598 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  30.58 
 
 		 627 aa  273  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  31.22 
 
 		 645 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  31.29 
 
 		 611 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  30.9 
 
 		 598 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  30.44 
 
 		 617 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  31.16 
 
 		 626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1274  glycoside hydrolase 15-related  32.59 
 
 		 628 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.716617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  31.95 
 
 		 629 aa  271  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>