More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0312 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  61.55 
 
 		 813 aa  1018    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  45.02 
 
 		 846 aa  695    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  44.54 
 
 		 798 aa  662    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  100 
 
 		 807 aa  1657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  37.81 
 
 		 821 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 731 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 736 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 739 aa  354  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 711 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 710 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  24.18 
 
 		 782 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.69 
 
 		 782 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  22.35 
 
 		 696 aa  127  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 		 675 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  21.64 
 
 		 703 aa  122  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 777 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 		 704 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  23.71 
 
 		 731 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.84 
 
 		 774 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24 
 
 		 784 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.69 
 
 		 784 aa  115  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 774 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  22.79 
 
 		 774 aa  114  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  22.79 
 
 		 774 aa  114  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 774 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  22.64 
 
 		 774 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.17 
 
 		 712 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  24.11 
 
 		 717 aa  110  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 774 aa  110  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  22.41 
 
 		 688 aa  107  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  21.67 
 
 		 807 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.5 
 
 		 784 aa  104  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  21.97 
 
 		 708 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  21.47 
 
 		 687 aa  100  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  21.44 
 
 		 693 aa  98.6  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  20.83 
 
 		 809 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  21.07 
 
 		 809 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  20.83 
 
 		 809 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  21.13 
 
 		 809 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  23.21 
 
 		 723 aa  95.1  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.35 
 
 		 713 aa  94.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 720 aa  92  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  21.94 
 
 		 690 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  21.26 
 
 		 731 aa  88.2  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  20.85 
 
 		 782 aa  87.8  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 700 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  19.36 
 
 		 721 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  20.03 
 
 		 721 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  21.24 
 
 		 789 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  21.61 
 
 		 738 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 737 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  21.1 
 
 		 742 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  21.23 
 
 		 742 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  21.57 
 
 		 748 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  21.57 
 
 		 748 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  31.82 
 
 		 518 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  24.18 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  21.56 
 
 		 712 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.32 
 
 		 705 aa  68.2  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 726 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 621 aa  67  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 814 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  21.29 
 
 		 749 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 770 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  20.9 
 
 		 740 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 709 aa  64.7  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  22.12 
 
 		 704 aa  64.3  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  22.41 
 
 		 811 aa  64.3  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  20.82 
 
 		 812 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 958 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  24.71 
 
 		 848 aa  62  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 734 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 697 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 742 aa  61.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  22.12 
 
 		 815 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 795 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  21.51 
 
 		 795 aa  61.2  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 757 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 776 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  21.57 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  20.96 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 999 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 768 aa  58.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 768 aa  58.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 785 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  23.13 
 
 		 809 aa  57.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  21.35 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  20.66 
 
 		 777 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  26.52 
 
 		 960 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  19.47 
 
 		 738 aa  57  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 866 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  26.57 
 
 		 618 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.6 
 
 		 750 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 821 aa  55.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 817 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>