More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0302 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
103 aa  213  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
109 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  54.95 
 
 
111 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
108 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  45.83 
 
 
146 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
109 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
116 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
116 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
109 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
109 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  54.95 
 
 
111 aa  103  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  44 
 
 
109 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 
97 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  50.56 
 
 
107 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
127 aa  99  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  43.43 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 
111 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
111 aa  97.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  41.58 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  51.69 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  45.26 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  43.14 
 
 
110 aa  92.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  39.13 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  35.37 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  45.59 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  38.75 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
114 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  46.77 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  46.77 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  32.5 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
115 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
105 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  36.51 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  36.36 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
120 aa  53.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  40.54 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  32.5 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.88 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  43.24 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0550  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 
99 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  45.31 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 
99 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
99 aa  52  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 
99 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
88 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 
99 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
125 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 
99 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 
125 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>